223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09628 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  371  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  64.52 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  41.3 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  45.36 
 
 		 187 aa  164  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  42.62 
 
 		 186 aa  154  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  42.22 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  37.16 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  37.3 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  33.87 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  37.7 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  37.91 
 
 		 182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  35.8 
 
 		 187 aa  127  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  37.16 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  34.97 
 
 		 189 aa  124  7e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  34.64 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5633  protein of unknown function DUF179  35.21 
 
 		 146 aa  101  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591685  normal  0.939371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  26.78 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  27.87 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  32.6 
 
 		 190 aa  85.1  5e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  26.49 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  27.37 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  26.92 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  29.24 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  29.65 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  30.65 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  33.99 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  28.81 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0457  hypothetical protein  24.06 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  32.89 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  29.41 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  29.51 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  33.77 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  26.94 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  29.21 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  32.89 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  28.49 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  29.28 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  30.46 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  30.46 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  30.46 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  29.53 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  29.28 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  27.08 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  26.49 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  30.27 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  27.84 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  27.11 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  29.38 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  29.48 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  28 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  27.22 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  27.52 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  29.8 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  29.03 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  30.48 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  30.97 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  26.18 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  28.21 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  27.37 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  22.99 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  26.63 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  32.88 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0426  hypothetical protein  25.47 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.152287  normal  0.709849 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  30.73 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  26.04 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3962  hypothetical protein  25.14 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  29.24 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  29.26 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  29.1 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  27.17 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  31.79 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  29.26 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  31.94 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  29.14 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  33.11 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  29.03 
 
 		 213 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  30.72 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  27.68 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  30.86 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  32.17 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  28.18 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  28.4 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  28.92 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  30.29 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  30.29 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  30.29 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  24.86 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  30.12 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  29.8 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  29.07 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  30.12 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  30.29 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  30.29 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  25.28 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  29.37 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  29.8 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  29.03 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  29.22 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  25.41 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88895  predicted protein  29.66 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0380911  hitchhiker  0.00603627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>