More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08326 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  56.96 
 
 		 555 aa  655    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  56.96 
 
 		 555 aa  655    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.84 
 
 		 559 aa  786    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.73 
 
 		 555 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.27 
 
 		 556 aa  651    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 		 555 aa  681    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.81 
 
 		 555 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1183  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.53 
 
 		 554 aa  643    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.976373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 559 aa  646    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4905  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 555 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.27 
 
 		 558 aa  854    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  57.27 
 
 		 563 aa  651    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.68 
 
 		 550 aa  657    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.01 
 
 		 551 aa  654    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.94 
 
 		 559 aa  702    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.79 
 
 		 555 aa  652    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.81 
 
 		 557 aa  661    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.99 
 
 		 557 aa  663    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.27 
 
 		 554 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0671  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.68 
 
 		 555 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.41 
 
 		 560 aa  753    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6356  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.39 
 
 		 550 aa  659    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109322 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4941  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.79 
 
 		 555 aa  653    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.963786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.17 
 
 		 558 aa  730    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.82 
 
 		 550 aa  657    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.6 
 
 		 555 aa  643    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.64 
 
 		 560 aa  716    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.6 
 
 		 557 aa  673    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.19 
 
 		 554 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.91 
 
 		 551 aa  659    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.54 
 
 		 561 aa  748    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4991  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 555 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1137  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.68 
 
 		 560 aa  700    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000210355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.36 
 
 		 558 aa  766    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.65 
 
 		 561 aa  775    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.17 
 
 		 559 aa  744    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.49 
 
 		 559 aa  783    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2891  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 		 559 aa  640    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.315278  decreased coverage  0.00408651 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.29 
 
 		 561 aa  717    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.97 
 
 		 556 aa  644    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.12 
 
 		 559 aa  659    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.86 
 
 		 554 aa  643    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 559 aa  658    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2810  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.04 
 
 		 555 aa  640    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.77 
 
 		 561 aa  759    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.89 
 
 		 551 aa  652    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.59 
 
 		 555 aa  818    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 549 aa  638    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.53 
 
 		 559 aa  656    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.68 
 
 		 551 aa  677    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.73 
 
 		 555 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4993  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 555 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.3 
 
 		 553 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3678  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.27 
 
 		 555 aa  645    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0822  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.89 
 
 		 555 aa  640    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7137  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 550 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.91 
 
 		 551 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.79 
 
 		 549 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2626  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 578 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.663821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.21 
 
 		 550 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  655    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.36 
 
 		 560 aa  714    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.78 
 
 		 555 aa  679    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.17 
 
 		 555 aa  679    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 		 670 aa  637    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  656    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04232  hypothetical protein  56.96 
 
 		 555 aa  655    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.91 
 
 		 555 aa  646    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1270  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.71 
 
 		 555 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0706  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.91 
 
 		 555 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.483075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.89 
 
 		 555 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.95 
 
 		 556 aa  806    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4832  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 555 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.04 
 
 		 555 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.95 
 
 		 561 aa  763    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0552  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.31 
 
 		 555 aa  650    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1093  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.18 
 
 		 555 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.53945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1159  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.18 
 
 		 555 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.57 
 
 		 555 aa  689    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1032  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.71 
 
 		 555 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.99 
 
 		 555 aa  646    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0269  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.01 
 
 		 561 aa  654    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5906  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  655    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 549 aa  639    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.86 
 
 		 549 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 555 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.79 
 
 		 558 aa  711    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.22 
 
 		 561 aa  760    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.78 
 
 		 560 aa  657    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1093  putative ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 555 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.89 
 
 		 555 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  65 
 
 		 559 aa  753    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1826  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 		 550 aa  638    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.96 
 
 		 551 aa  666    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  83.84 
 
 		 563 aa  989    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1013  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.54 
 
 		 555 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.99 
 
 		 559 aa  645    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3665  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  655    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.03 
 
 		 551 aa  684    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.91 
 
 		 553 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>