More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02890 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02890  putative peptidase  100 
 
 
320 aa  645    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.648813  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0307  Peptidase M23  30.83 
 
 
298 aa  155  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000988851  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0690  hypothetical protein  32.9 
 
 
297 aa  154  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1024  hypothetical protein  53.62 
 
 
167 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2508  Peptidase M23  44.95 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.290158  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  38.3 
 
 
273 aa  106  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  50.51 
 
 
379 aa  102  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1042  secreted peptidase, family M23  35.76 
 
 
166 aa  102  9e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  43.7 
 
 
419 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  41.03 
 
 
452 aa  99.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  46 
 
 
411 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  43.27 
 
 
400 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  41.18 
 
 
375 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6607  hypothetical protein  37.9 
 
 
134 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.103654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  44.12 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  38.35 
 
 
292 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  38.89 
 
 
309 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  37.59 
 
 
291 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  41.41 
 
 
379 aa  94  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  37.59 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  38.98 
 
 
301 aa  94  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  45.26 
 
 
404 aa  92.4  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  31.22 
 
 
430 aa  92.8  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  46 
 
 
431 aa  92.4  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  39.53 
 
 
287 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  42.59 
 
 
824 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  42.42 
 
 
375 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  44.07 
 
 
324 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  36.09 
 
 
372 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  38.46 
 
 
284 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.24 
 
 
304 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  38.21 
 
 
340 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2192  M24/M37 family peptidase  42.86 
 
 
337 aa  90.9  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  39.5 
 
 
305 aa  90.1  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  37.84 
 
 
460 aa  90.1  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  45.45 
 
 
441 aa  90.5  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  38.33 
 
 
459 aa  90.5  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  36.51 
 
 
252 aa  89.7  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  34.33 
 
 
298 aa  90.1  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  44.44 
 
 
399 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  44.44 
 
 
399 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  43.14 
 
 
446 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  42.86 
 
 
582 aa  89.7  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  34.96 
 
 
314 aa  89.7  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  37.93 
 
 
404 aa  89.7  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  41.03 
 
 
468 aa  89.4  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  46.46 
 
 
373 aa  89.4  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  42.86 
 
 
323 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  35.77 
 
 
305 aa  89  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.82 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  40.38 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  39.82 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  33.57 
 
 
285 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  46.46 
 
 
394 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  35.16 
 
 
249 aa  87  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  38.24 
 
 
291 aa  87  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  35.88 
 
 
610 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  34.48 
 
 
313 aa  86.7  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  40.17 
 
 
360 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  39.09 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  39.53 
 
 
350 aa  86.3  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  34.78 
 
 
411 aa  85.9  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  39.09 
 
 
369 aa  85.9  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  36.3 
 
 
332 aa  85.9  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  29.37 
 
 
375 aa  85.9  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  33.1 
 
 
524 aa  85.9  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  40.74 
 
 
751 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  38.69 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  39.5 
 
 
486 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  26.37 
 
 
527 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  40.18 
 
 
482 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  36.13 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  39.29 
 
 
230 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  36.13 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  34.45 
 
 
439 aa  84.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  41.05 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  39.81 
 
 
727 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  31.22 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  28.64 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  31.21 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  41.41 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  38.31 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  36.13 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  39.53 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  39.81 
 
 
727 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  27.31 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  36.13 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  36.13 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  36.15 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  35.9 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  37.8 
 
 
352 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  39.22 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  36.63 
 
 
243 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  41.9 
 
 
284 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  42.48 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  36.44 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  47.37 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  35.29 
 
 
440 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  35.29 
 
 
440 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  35.29 
 
 
440 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>