More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2508 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2508  Peptidase M23  100 
 
 		 262 aa  534  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.290158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0690  hypothetical protein  40.65 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02890  putative peptidase  44.95 
 
 		 320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.648813  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  52 
 
 		 419 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0307  Peptidase M23  43.75 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000988851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  42.61 
 
 		 452 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  45 
 
 		 375 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  49.49 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  47.47 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  50.51 
 
 		 324 aa  97.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  48.48 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  48.48 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  30.04 
 
 		 334 aa  95.9  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  36.22 
 
 		 274 aa  95.5  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  39.71 
 
 		 301 aa  95.1  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  44.35 
 
 		 582 aa  95.1  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  41.94 
 
 		 367 aa  94.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  46.46 
 
 		 411 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  41.51 
 
 		 373 aa  92  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  47.01 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  38.81 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  34.18 
 
 		 379 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.46 
 
 		 321 aa  90.1  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  35.39 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  34.3 
 
 		 375 aa  89  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  41.03 
 
 		 320 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  27.08 
 
 		 274 aa  88.6  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  44.44 
 
 		 400 aa  88.6  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  38.46 
 
 		 318 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  35.88 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  30.5 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  40.16 
 
 		 527 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  45.45 
 
 		 346 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  43.7 
 
 		 309 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  46.32 
 
 		 410 aa  86.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  46.32 
 
 		 438 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  40.35 
 
 		 468 aa  87  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  46.32 
 
 		 438 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  30.41 
 
 		 378 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  31.32 
 
 		 412 aa  86.7  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  45.26 
 
 		 439 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  45.26 
 
 		 439 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  45.26 
 
 		 439 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  45.26 
 
 		 439 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  45.26 
 
 		 439 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  41.51 
 
 		 404 aa  85.9  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  42.42 
 
 		 430 aa  85.5  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  42 
 
 		 265 aa  85.5  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  35.8 
 
 		 273 aa  85.5  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  43.56 
 
 		 430 aa  85.5  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  30 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  46.32 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  42.16 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  42.42 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  45.26 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  32.09 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  39.84 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  36.36 
 
 		 735 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  35.77 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  43 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  43.16 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  43.16 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  43.16 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  43.16 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  40.17 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  32.43 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  40.65 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  39.83 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  35.23 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  43.16 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  43.16 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  40.4 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  45.26 
 
 		 486 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  43.16 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.35 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  43.16 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  35.9 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  43.16 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  34.43 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  39.32 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  43.16 
 
 		 441 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  43.16 
 
 		 470 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  43.16 
 
 		 440 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  38.84 
 
 		 605 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  36.97 
 
 		 411 aa  82.4  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  37.61 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  40.16 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  38.64 
 
 		 305 aa  82  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  41.61 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  30.54 
 
 		 460 aa  82  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  39.34 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  40.16 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  36.07 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  35.76 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  34.62 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  34.62 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  42 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  40 
 
 		 541 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  40.94 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  29.35 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>