More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00815 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  63.85 
 
 		 647 aa  882    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  78.33 
 
 		 647 aa  1066    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  61.67 
 
 		 653 aa  839    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  67.66 
 
 		 641 aa  940    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 604 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 		 657 aa  684    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 648 aa  1346    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  65.26 
 
 		 647 aa  903    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 638 aa  638    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 677 aa  702    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 657 aa  686    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  81.54 
 
 		 648 aa  1103    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 657 aa  680    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 649 aa  644    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 645 aa  923    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  66 
 
 		 646 aa  919    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  59.32 
 
 		 662 aa  813    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 657 aa  703    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 675 aa  712    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 659 aa  681    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  64.32 
 
 		 644 aa  886    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 645 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 636 aa  627  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 652 aa  626  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 638 aa  627  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 643 aa  622  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 645 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 645 aa  619  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 645 aa  619  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 645 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 636 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 645 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4204  threonyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 736 aa  619  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 644 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 645 aa  617  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 645 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 636 aa  617  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 645 aa  617  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 645 aa  616  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 645 aa  616  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 648 aa  618  1e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 635 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 635 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 645 aa  609  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 639 aa  610  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 645 aa  609  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 643 aa  610  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 634 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 596 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 646 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 648 aa  607  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 636 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 647 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 642 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 630 aa  605  1.0000000000000001e-171  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 643 aa  599  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 639 aa  600  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 635 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 635 aa  600  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 636 aa  595  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 633 aa  598  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 644 aa  592  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 648 aa  593  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 644 aa  592  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 637 aa  589  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 635 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 635 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 635 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 647 aa  585  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 635 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 635 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 635 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 608 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 644 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 635 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 635 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 644 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 635 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 635 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 635 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 635 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 635 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 635 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 635 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 637 aa  579  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 640 aa  578  1e-164  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 635 aa  581  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 634 aa  581  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 644 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 640 aa  577  1.0000000000000001e-163  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 644 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 638 aa  578  1.0000000000000001e-163  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 659 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 610 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 644 aa  578  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 640 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 644 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 635 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>