More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0528 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0979  NADH dehydrogenase  57.1 
 
 		 632 aa  709    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1462  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  74.16 
 
 		 627 aa  909    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.185641 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1670  hydrogen dehydrogenase  55.93 
 
 		 598 aa  665    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3858  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  73.14 
 
 		 603 aa  872    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2247  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  60.72 
 
 		 627 aa  677    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179824  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0528  putative NADH dehydrogenase subunit  100 
 
 		 610 aa  1241    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2724  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  51.29 
 
 		 610 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000462044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1217  hydrogenase, NADP-reducing subunit C  47.16 
 
 		 588 aa  550  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.180172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2751  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  44.27 
 
 		 603 aa  488  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4116  hydrogen dehydrogenase  44.63 
 
 		 603 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502813  normal  0.19956 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1522  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  41.4 
 
 		 602 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000148322  hitchhiker  0.000569435 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  41.78 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  41.56 
 
 		 407 aa  311  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  42.32 
 
 		 572 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  42.41 
 
 		 535 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  43.08 
 
 		 596 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  41.36 
 
 		 562 aa  307  5.0000000000000004e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  36.23 
 
 		 597 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  40.8 
 
 		 614 aa  306  8.000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  36.25 
 
 		 656 aa  306  9.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  34.89 
 
 		 602 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  38.93 
 
 		 572 aa  302  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  40.57 
 
 		 610 aa  301  2e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  40.63 
 
 		 438 aa  301  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  41.18 
 
 		 407 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  36.85 
 
 		 597 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  43.63 
 
 		 594 aa  300  7e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  37.6 
 
 		 590 aa  299  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.58 
 
 		 444 aa  298  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  42.04 
 
 		 604 aa  297  5e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  40.31 
 
 		 607 aa  297  5e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  40.31 
 
 		 607 aa  297  5e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  39.64 
 
 		 539 aa  295  1e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  39.9 
 
 		 545 aa  295  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.59 
 
 		 421 aa  294  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  39.12 
 
 		 571 aa  294  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  40.31 
 
 		 488 aa  293  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  35.63 
 
 		 535 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  32.88 
 
 		 614 aa  293  7e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  35.42 
 
 		 535 aa  293  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  34.86 
 
 		 626 aa  293  9e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  42.62 
 
 		 596 aa  292  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0844  NADH dehydrogenase (quinone)  41.15 
 
 		 562 aa  292  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0257852  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.86 
 
 		 446 aa  292  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  39.01 
 
 		 486 aa  291  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  36.48 
 
 		 530 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.96 
 
 		 426 aa  290  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.24 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.24 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.24 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.15 
 
 		 636 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  39.01 
 
 		 486 aa  289  9e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  39.01 
 
 		 486 aa  289  9e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.59 
 
 		 425 aa  289  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  39.37 
 
 		 545 aa  288  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  37.35 
 
 		 535 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  33.58 
 
 		 603 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  42.86 
 
 		 591 aa  287  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  39.38 
 
 		 407 aa  287  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  39.11 
 
 		 545 aa  286  5e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  41.78 
 
 		 591 aa  286  7e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  33.81 
 
 		 636 aa  286  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0279  NADH dehydrogenase (quinone)  40.79 
 
 		 534 aa  286  9e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  41.41 
 
 		 656 aa  286  9e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0807  NADH dehydrogenase (quinone)  41.91 
 
 		 404 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  37.99 
 
 		 538 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  42.75 
 
 		 445 aa  284  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  40.91 
 
 		 448 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  41.89 
 
 		 668 aa  283  6.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  35.07 
 
 		 552 aa  283  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  39.3 
 
 		 624 aa  283  8.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  41.97 
 
 		 593 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  41.71 
 
 		 593 aa  282  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  41.06 
 
 		 431 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1311  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.93 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.22 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.94 
 
 		 438 aa  281  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0784  NADH dehydrogenase (quinone)  39.11 
 
 		 408 aa  281  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  39.49 
 
 		 629 aa  281  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  38.83 
 
 		 448 aa  280  4e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.4 
 
 		 456 aa  281  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.58 
 
 		 434 aa  281  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02209  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain F  41.91 
 
 		 445 aa  280  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1373  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.91 
 
 		 445 aa  280  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00215992  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3423  NADH dehydrogenase I subunit F  41.91 
 
 		 445 aa  280  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2438  NADH dehydrogenase I subunit F  41.91 
 
 		 445 aa  280  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  39.75 
 
 		 446 aa  280  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  39.74 
 
 		 485 aa  280  5e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  41.91 
 
 		 445 aa  280  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  41.91 
 
 		 445 aa  280  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02169  hypothetical protein  41.91 
 
 		 445 aa  280  5e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  41.91 
 
 		 445 aa  280  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2433  NADH dehydrogenase I subunit F  41.91 
 
 		 445 aa  280  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02970  NADH dehydrogenase I subunit F  40.37 
 
 		 408 aa  280  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0225  NADH dehydrogenase (quinone)  39.58 
 
 		 417 aa  280  6e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1496  NADH dehydrogenase I subunit F  43.05 
 
 		 449 aa  280  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.376582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  40.45 
 
 		 422 aa  280  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.09 
 
 		 447 aa  280  8e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_002936  DET0146  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  39.9 
 
 		 417 aa  279  9e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28536  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  33.06 
 
 		 597 aa  279  9e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>