71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0295 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  100 
 
 		 186 aa  383  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  44.32 
 
 		 182 aa  158  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  43.26 
 
 		 181 aa  157  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  38.41 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  38.41 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  37.35 
 
 		 172 aa  111  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  37.28 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  35.56 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  35.19 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  35.58 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  35.76 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  34.55 
 
 		 179 aa  98.2  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  33.96 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  28.74 
 
 		 175 aa  91.7  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.35 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  31.74 
 
 		 181 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  31.74 
 
 		 181 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  31.74 
 
 		 181 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3276  hypothetical protein  38.89 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52081  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  34.71 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  31.91 
 
 		 151 aa  74.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  30.07 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  25.69 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  29.86 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  32.12 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2908  hypothetical protein  31.32 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.47 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3461  hypothetical protein  29.52 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  26.21 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  26.44 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  29.45 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.94 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  40.85 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  25.87 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  25.87 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  25.79 
 
 		 658 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  26.77 
 
 		 164 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  26.17 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0436  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.06 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  29.36 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  23.13 
 
 		 182 aa  48.5  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.4 
 
 		 131 aa  48.5  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  29.53 
 
 		 141 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  28.04 
 
 		 135 aa  48.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2939  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.44 
 
 		 190 aa  47.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  25 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  25 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0659  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00502246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  25 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1126  hypothetical protein  28.03 
 
 		 135 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  26.38 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1341  methylmalonyl-CoA epimerase  26.43 
 
 		 136 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.886384  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  28.3 
 
 		 135 aa  45.4  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.36 
 
 		 135 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0877  methylmalonyl-CoA epimerase  25.23 
 
 		 134 aa  44.7  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157449  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1175  methylmalonyl-CoA epimerase  22.94 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1949  methylmalonyl-CoA epimerase  24.18 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.331779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.23 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  28.89 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 		 134 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.38 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2781  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.09 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2348  methylmalonyl-CoA epimerase  31.82 
 
 		 131 aa  42.4  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  30.85 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0306  hypothetical protein  26.62 
 
 		 162 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.451967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3641  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.7 
 
 		 352 aa  41.6  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.258218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.18 
 
 		 161 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.2 
 
 		 133 aa  41.2  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0639  methylmalonyl-CoA epimerase  22.6 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.237468  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  29.41 
 
 		 139 aa  41.2  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>