More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0086 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  81.68 
 
 		 259 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  80.08 
 
 		 265 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  79.69 
 
 		 265 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  76.56 
 
 		 265 aa  387  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  74.61 
 
 		 265 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  74.61 
 
 		 265 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  74.22 
 
 		 265 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  74.22 
 
 		 265 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  68.99 
 
 		 263 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  66.67 
 
 		 258 aa  348  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  68.99 
 
 		 263 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  64.71 
 
 		 262 aa  336  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  65.88 
 
 		 262 aa  335  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  63.18 
 
 		 271 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  62.4 
 
 		 271 aa  330  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  68.16 
 
 		 269 aa  329  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  60.08 
 
 		 270 aa  315  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  62.93 
 
 		 263 aa  315  6e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0048  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  58.03 
 
 		 279 aa  313  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0941519 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  59.69 
 
 		 270 aa  311  7.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  63.2 
 
 		 264 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.51 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  54.2 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  53.44 
 
 		 262 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  53.44 
 
 		 262 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 		 261 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.81 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  56.07 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  52.42 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0255  taurine transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 		 264 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0247  taurine transporter ATP-binding subunit  53.05 
 
 		 262 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.09148  normal  0.145394 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  52.82 
 
 		 255 aa  261  8e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  52.82 
 
 		 255 aa  261  8e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  52.82 
 
 		 255 aa  261  8e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  52.82 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  52.82 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  52.82 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  52.82 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  52.42 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  51.61 
 
 		 255 aa  255  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  53.6 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  50.77 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  50.77 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  53.2 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  50.77 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  52.59 
 
 		 278 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  47.01 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  51 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.62 
 
 		 253 aa  246  4e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  49.62 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  49.41 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  49.8 
 
 		 259 aa  235  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  48.11 
 
 		 259 aa  234  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.66 
 
 		 262 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  48.75 
 
 		 266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  51.38 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.14 
 
 		 258 aa  231  6e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  48.47 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.8 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  51.77 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  53.75 
 
 		 293 aa  228  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.02 
 
 		 254 aa  228  9e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.72 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  53.33 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  48.8 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  52.68 
 
 		 252 aa  227  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  47.08 
 
 		 267 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.25 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  51.8 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.41 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  49.36 
 
 		 274 aa  225  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.88 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  44.15 
 
 		 259 aa  225  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.17 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.9 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4922  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.94 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659379  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  44.79 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.17 
 
 		 259 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  53.85 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40.62 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1024  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.75 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0928841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  45.56 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.17 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  47.04 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 267 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  49.78 
 
 		 288 aa  221  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  52.61 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  44.15 
 
 		 259 aa  221  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  49.15 
 
 		 271 aa  221  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  48.29 
 
 		 267 aa  221  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>