More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2677 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  100 
 
 
245 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.98 
 
 
244 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.64 
 
 
245 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  49.8 
 
 
257 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
250 aa  208  7e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.54 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
257 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 
241 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
272 aa  178  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
242 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.31 
 
 
252 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
233 aa  169  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
237 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.88 
 
 
245 aa  168  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
246 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
245 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
263 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
244 aa  166  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.35 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  43.03 
 
 
244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
247 aa  161  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
238 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
241 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 
227 aa  158  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
246 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
270 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
238 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
229 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
249 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
244 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
248 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 
229 aa  148  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
250 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 
236 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  34.71 
 
 
236 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  36.82 
 
 
240 aa  138  7.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 
236 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 
236 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 
231 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
240 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
243 aa  128  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
248 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
237 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 
232 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  37.08 
 
 
309 aa  122  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406317 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
236 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
265 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
236 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07268  short chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00840)  33.86 
 
 
245 aa  121  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.886513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01679  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase  36.33 
 
 
242 aa  121  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
237 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
264 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0396  carbonyl reductase  30.7 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 
236 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
231 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02865  short chain dehydrogenase  37.62 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
236 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003017  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  37.32 
 
 
248 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00557089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
261 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32556  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
316 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.14 
 
 
246 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  36.71 
 
 
264 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  39.22 
 
 
263 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00525  conserved hypothetical protein  32.7 
 
 
263 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.30588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.17 
 
 
245 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11468  acetoin(diacetyl)reductase  32.14 
 
 
254 aa  105  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0328388  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
259 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 
256 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  37.12 
 
 
274 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1674  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.41 
 
 
261 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  35.15 
 
 
254 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
260 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  31.1 
 
 
308 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 
225 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31851  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.48 
 
 
248 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
254 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35 
 
 
249 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 
245 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.67 
 
 
246 aa  102  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 
257 aa  101  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
257 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
256 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281486  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  32.69 
 
 
311 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.31 
 
 
247 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1835  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.47 
 
 
247 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0909527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
239 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44630  predicted protein  30.6 
 
 
277 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847345  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
245 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
254 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  30.14 
 
 
300 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
257 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1470  gluconate 5-dehydrogenase  32.2 
 
 
254 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  32.2 
 
 
254 aa  99.8  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>