More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1901 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.95 
 
 
635 aa  856    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.97 
 
 
658 aa  893    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.22 
 
 
666 aa  842    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  59.2 
 
 
646 aa  721    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.22 
 
 
666 aa  842    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  58.76 
 
 
627 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.22 
 
 
852 aa  840    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  68.37 
 
 
917 aa  842    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  69.84 
 
 
692 aa  882    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.33 
 
 
676 aa  889    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  60.03 
 
 
635 aa  720    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.64 
 
 
662 aa  837    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.65 
 
 
696 aa  699    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.3 
 
 
663 aa  691    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.81 
 
 
655 aa  865    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.65 
 
 
714 aa  700    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.3 
 
 
663 aa  691    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.2 
 
 
653 aa  845    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  100 
 
 
659 aa  1324    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.65 
 
 
658 aa  876    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.22 
 
 
666 aa  842    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.37 
 
 
666 aa  843    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.38 
 
 
655 aa  865    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.97 
 
 
635 aa  853    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.37 
 
 
666 aa  843    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.65 
 
 
658 aa  876    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.26 
 
 
647 aa  661    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.75 
 
 
697 aa  590  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.75 
 
 
687 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  48.25 
 
 
694 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.93 
 
 
705 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  51.65 
 
 
630 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
607 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.55 
 
 
706 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.22 
 
 
605 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  50.08 
 
 
702 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  50.89 
 
 
605 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.84 
 
 
623 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.28 
 
 
697 aa  568  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.71 
 
 
610 aa  569  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.25 
 
 
610 aa  569  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  50.89 
 
 
615 aa  568  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  49.07 
 
 
627 aa  568  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.28 
 
 
635 aa  568  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.44 
 
 
624 aa  568  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.32 
 
 
686 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.22 
 
 
615 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.23 
 
 
694 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.17 
 
 
646 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  48.53 
 
 
699 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.17 
 
 
646 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.63 
 
 
639 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  51.57 
 
 
616 aa  559  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.68 
 
 
618 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  49.75 
 
 
621 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.18 
 
 
699 aa  560  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.03 
 
 
630 aa  560  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.14 
 
 
633 aa  560  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.76 
 
 
618 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  46.83 
 
 
614 aa  555  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.77 
 
 
637 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.74 
 
 
612 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2062  vesicle-fusing ATPase  51.4 
 
 
617 aa  555  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139839  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  47.95 
 
 
706 aa  553  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 
645 aa  553  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.58 
 
 
612 aa  554  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.28 
 
 
625 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6007  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.72 
 
 
645 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  51.19 
 
 
645 aa  551  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.99 
 
 
640 aa  550  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
623 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.55 
 
 
645 aa  549  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.25 
 
 
607 aa  550  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.39 
 
 
641 aa  545  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  47.85 
 
 
608 aa  547  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.69 
 
 
602 aa  548  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.1 
 
 
617 aa  548  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.45 
 
 
626 aa  544  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  49.83 
 
 
640 aa  542  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.3 
 
 
676 aa  544  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.59 
 
 
652 aa  545  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.27 
 
 
645 aa  545  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.68 
 
 
611 aa  544  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.77 
 
 
673 aa  542  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.12 
 
 
647 aa  542  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  45.68 
 
 
638 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.58 
 
 
610 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  48.02 
 
 
644 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  48.18 
 
 
649 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  46.75 
 
 
626 aa  538  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.68 
 
 
714 aa  541  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.66 
 
 
636 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.42 
 
 
618 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  43.62 
 
 
764 aa  540  9.999999999999999e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.07 
 
 
640 aa  541  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.02 
 
 
637 aa  539  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  45.58 
 
 
681 aa  540  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.44 
 
 
641 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.66 
 
 
651 aa  538  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  54.31 
 
 
623 aa  538  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>