201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1170 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  100 
 
 
408 aa  801    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  33.62 
 
 
394 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  31.62 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  33.53 
 
 
434 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  32.61 
 
 
409 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  33.72 
 
 
414 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  30.34 
 
 
408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  31.82 
 
 
399 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0746  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 
396 aa  143  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  32.63 
 
 
426 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  32.75 
 
 
426 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0406  putative cyanate transporter  33.72 
 
 
384 aa  142  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.480535  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 
426 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0366  putative cyanate transporter  33.43 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0863543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00295  predicted cyanate transporter  33.43 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3265  cyanate transporter  33.43 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3284  putative cyanate transporter  33.43 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.464523  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0372  putative cyanate transporter  33.43 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.552261  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00299  hypothetical protein  33.43 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0414  putative cyanate transporter  33.14 
 
 
384 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  33.43 
 
 
426 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  31.86 
 
 
426 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  30.41 
 
 
398 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  31.67 
 
 
434 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  33.53 
 
 
424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  30.34 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 
411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  28.7 
 
 
394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1011  major facilitator superfamily transporter  29.49 
 
 
390 aa  126  6e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.355003  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  31.43 
 
 
407 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  31.74 
 
 
409 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1184  hypothetical protein  28.14 
 
 
387 aa  122  9e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.497488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03550  putative MFS transporter  35.11 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0168326  hitchhiker  0.00000000000715422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 
413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3444  major facilitator transporter  31.56 
 
 
419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  31.67 
 
 
391 aa  119  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  32.36 
 
 
409 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  33.14 
 
 
432 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  27.98 
 
 
368 aa  117  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  32.85 
 
 
424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  31.67 
 
 
382 aa  117  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  30.81 
 
 
409 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  31.39 
 
 
401 aa  116  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  32.54 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  31.96 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4832  major facilitator transporter  28 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0209753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2392  major facilitator family transporter  32.36 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32330  putative cyanate permease  28.17 
 
 
408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2152  major facilitator transporter  29.97 
 
 
398 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4522  major facilitator transporter  30.09 
 
 
390 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1589  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 
389 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000189981  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3751  major facilitator transporter  28.08 
 
 
398 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389942  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  27.27 
 
 
434 aa  112  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  28.61 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  28.9 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1597  major facilitator transporter  28.82 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  28.9 
 
 
401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1245  major facilitator transporter  32.37 
 
 
383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.356347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2012  major facilitator transporter  27.79 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.579167 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
401 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  31.94 
 
 
403 aa  110  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1652  major facilitator transporter  28.06 
 
 
394 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  30.72 
 
 
403 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  28.77 
 
 
401 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 
430 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2739  MFS family transporter  30.17 
 
 
408 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5672  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
414 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5382  major facilitator transporter  31.95 
 
 
408 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
428 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0190  cyanate permease  29.32 
 
 
397 aa  107  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  29.39 
 
 
395 aa  107  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1199  major facilitator transporter  28.24 
 
 
392 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1679  major facilitator transporter  28.24 
 
 
392 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  29.91 
 
 
436 aa  106  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  30.92 
 
 
387 aa  106  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  29.34 
 
 
409 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  30.2 
 
 
419 aa  105  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0891  twin-arginine translocation pathway signal  30.17 
 
 
395 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1035  twin-arginine translocation pathway signal  30.17 
 
 
395 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
400 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2387  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
384 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  28.57 
 
 
391 aa  104  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  28.49 
 
 
403 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2483  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
393 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.566697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  28.81 
 
 
393 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  28.81 
 
 
393 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  28.81 
 
 
393 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  28.81 
 
 
393 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
437 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  28.81 
 
 
393 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  28.81 
 
 
393 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 
399 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4252  major facilitator transporter  31.77 
 
 
405 aa  99.8  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  28.53 
 
 
393 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2202  major facilitator transporter  31.55 
 
 
420 aa  99.4  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  28.33 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>