140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3555 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  358  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2698  hypothetical protein  68.97 
 
 		 174 aa  231  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2563  hypothetical protein  63.07 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0867  hypothetical protein  60.44 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3712  hypothetical protein  67.47 
 
 		 188 aa  202  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3943  hypothetical protein  59.55 
 
 		 190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148213  normal  0.123195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  41.24 
 
 		 216 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  42.13 
 
 		 210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  37.11 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  40.31 
 
 		 194 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  40.31 
 
 		 194 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  40.31 
 
 		 194 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  39.27 
 
 		 198 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  40.31 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  46.49 
 
 		 195 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  38.22 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  35.79 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  46.02 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  38.22 
 
 		 194 aa  88.6  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  37.89 
 
 		 194 aa  87.8  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  34.72 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  43.24 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  42.48 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  42.48 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  34.9 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  38.28 
 
 		 591 aa  77  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  36.32 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  36.32 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  31.77 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0418  hypothetical protein  32.81 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159486  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  36.32 
 
 		 346 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  43.36 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  31.87 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  38.8 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  30.21 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  33.69 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  30 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  33.87 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.98 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  32.98 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  32.45 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  31.91 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  30.41 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.25 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  34.05 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.42 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.63 
 
 		 534 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.9 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  34.05 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  29.59 
 
 		 544 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  30.3 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  31.75 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.47 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 		 389 aa  58.9  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  32.29 
 
 		 455 aa  58.5  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1582  metal dependent phosphohydrolase  34.51 
 
 		 459 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.3 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  27.08 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  25 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.5 
 
 		 533 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  36.04 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  29.53 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.34 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 		 408 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  28.35 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  40.71 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.55 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 367 aa  55.1  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  27.04 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  29.02 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  30.21 
 
 		 534 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  28.72 
 
 		 575 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.75 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0228  uncharacterized MobA-related protein  31.3 
 
 		 363 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  39.47 
 
 		 200 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  31.2 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.57 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3453  metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  27.32 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  31.25 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.34 
 
 		 539 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  24.19 
 
 		 242 aa  50.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  28.49 
 
 		 534 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  27.59 
 
 		 368 aa  49.7  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  29.78 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.49 
 
 		 533 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  28.8 
 
 		 534 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1700  hypothetical protein  32.07 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.361045  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0243  MobA-like protein  24.24 
 
 		 216 aa  48.9  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00192406  normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  26.63 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 		 370 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0091  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.14 
 
 		 453 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.94 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  26.56 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  30.97 
 
 		 384 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  26.85 
 
 		 221 aa  48.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  31.53 
 
 		 372 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5193  hypothetical protein  30.2 
 
 		 211 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  28.86 
 
 		 538 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>