102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2285 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  761    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  63.64 
 
 		 369 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  64.36 
 
 		 365 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  55.85 
 
 		 382 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  54.45 
 
 		 382 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  54.79 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  55.32 
 
 		 382 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  55.03 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  55.03 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  54.88 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  52.36 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  52.36 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4638  putative glycosyl hydrolase  53.46 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0454186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  55.07 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  56.79 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  54.62 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  55.34 
 
 		 361 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  55.15 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  54.79 
 
 		 365 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  54.6 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  54.32 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  50.27 
 
 		 371 aa  360  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.97 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.83 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.26 
 
 		 361 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  35.69 
 
 		 362 aa  189  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.19 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.18 
 
 		 359 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  35.16 
 
 		 362 aa  185  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  34.76 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  34.41 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  36.16 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.7 
 
 		 366 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  33.97 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  31.58 
 
 		 371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4876  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 367 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3866  hypothetical protein  31.23 
 
 		 368 aa  152  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.14 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  25.68 
 
 		 608 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  27 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  27 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  25.07 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  24.93 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  25 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  24.93 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  25.57 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  23.92 
 
 		 681 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.73 
 
 		 694 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1090 aa  63.2  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  29.5 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 931 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  22.76 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  22.76 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  25.94 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  25.94 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  25.94 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  25.94 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  25.94 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  25.94 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  25.94 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  22.16 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 1078 aa  59.7  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  25.94 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.63 
 
 		 630 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  25.08 
 
 		 1084 aa  57.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  19.62 
 
 		 597 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  22.7 
 
 		 357 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  22.97 
 
 		 357 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1048 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  26.8 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.32 
 
 		 652 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 1063 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.23 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.98 
 
 		 909 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.31 
 
 		 310 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5003  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 350 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  22.76 
 
 		 357 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.33 
 
 		 345 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.33 
 
 		 345 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  22.49 
 
 		 357 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1043 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  21.9 
 
 		 1060 aa  53.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1054 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  25 
 
 		 1032 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 999 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  24.37 
 
 		 370 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  23.36 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 757 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.22 
 
 		 1082 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1060 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1147 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1075 aa  46.6  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.3 
 
 		 1041 aa  46.2  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  25.58 
 
 		 934 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 1044 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 1021 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  27.44 
 
 		 931 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>