97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6169 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 245 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.71 
 
 		 241 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.67 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.49 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3933  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.89 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0517801 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.5 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  46.86 
 
 		 241 aa  184  8e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.7 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  36.65 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.89 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 		 283 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 		 283 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.17 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.98 
 
 		 314 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.17 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 		 317 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.44 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 		 311 aa  101  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.22 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.34 
 
 		 310 aa  95.5  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 		 322 aa  95.5  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 		 193 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 		 327 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 303 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 		 355 aa  50.1  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820059  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.44 
 
 		 321 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 		 321 aa  48.5  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 314 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 		 321 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  26.44 
 
 		 321 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.43 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.44 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.44 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  26.44 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.07 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.44 
 
 		 321 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.44 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.44 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.44 
 
 		 321 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  30.21 
 
 		 318 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 278 aa  45.4  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.47 
 
 		 353 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 		 276 aa  45.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.36 
 
 		 353 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.51 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.83 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  42.65 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.28 
 
 		 354 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.485838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.89 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.73 
 
 		 353 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.488542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  30.32 
 
 		 342 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5682  GDP-mannose 4,6-dehydratase  36.25 
 
 		 323 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  42.37 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 		 319 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.73 
 
 		 353 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.69 
 
 		 307 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 		 313 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2250  UDP-glucose 4-epimerase  29.84 
 
 		 321 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2429  hypothetical protein  31.67 
 
 		 353 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143055  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  27.51 
 
 		 323 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.84 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  38.71 
 
 		 316 aa  42.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.1 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 		 306 aa  42.4  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 294 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.09 
 
 		 298 aa  42.4  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.38 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000135991  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  39.71 
 
 		 278 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 		 302 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 		 312 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.6 
 
 		 319 aa  42  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  38.6 
 
 		 319 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  34.33 
 
 		 279 aa  42  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1559  UDP-glucose 4-epimerase  31.94 
 
 		 338 aa  42  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0142095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  26.56 
 
 		 309 aa  42  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 		 320 aa  42  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1225  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 		 276 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44 
 
 		 346 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>