More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5986 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5986  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 270 aa  554  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2221  exodeoxyribonuclease III  94.81 
 
 		 270 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4910  exodeoxyribonuclease III  75 
 
 		 283 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.38033  decreased coverage  0.000445359 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5537  exodeoxyribonuclease III Xth  76.54 
 
 		 308 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  71.8 
 
 		 264 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09930  putative exonuclease III  72.93 
 
 		 266 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0994533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0921  exodeoxyribonuclease III  74.81 
 
 		 261 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  72.01 
 
 		 265 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2707  exodeoxyribonuclease III, putative  70.9 
 
 		 265 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3424  exodeoxyribonuclease III  68.54 
 
 		 272 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.903718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2668  exodeoxyribonuclease III Xth  70.93 
 
 		 260 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3010  exodeoxyribonuclease III Xth  68.16 
 
 		 265 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  62.55 
 
 		 260 aa  339  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  62.4 
 
 		 262 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  60.23 
 
 		 260 aa  337  9e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1207  exodeoxyribonuclease III (xth)  61.72 
 
 		 256 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3456  exodeoxyribonuclease III Xth  58.43 
 
 		 303 aa  329  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3068  exodeoxyribonuclease III Xth  62.35 
 
 		 255 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  61.05 
 
 		 269 aa  326  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3799  exodeoxyribonuclease III  60 
 
 		 256 aa  322  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  58.43 
 
 		 255 aa  321  7e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3423  exodeoxyribonuclease III  60.55 
 
 		 255 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3911  exodeoxyribonuclease III  58.91 
 
 		 271 aa  318  7.999999999999999e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3728  exodeoxyribonuclease III Xth  60.94 
 
 		 256 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1491  exodeoxyribonuclease III Xth  58.75 
 
 		 264 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  55.47 
 
 		 258 aa  316  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  58.43 
 
 		 261 aa  315  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.515839  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  58.37 
 
 		 259 aa  315  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0579  exodeoxyribonuclease III (xth)  58.46 
 
 		 274 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  56.03 
 
 		 259 aa  311  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1386  exodeoxyribonuclease III Xth  56.42 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.031293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2898  exodeoxyribonuclease III  60.62 
 
 		 284 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  58.04 
 
 		 257 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0877  exodeoxyribonuclease III Xth  56.25 
 
 		 264 aa  304  9.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2180  exodeoxyribonuclease III (xth)  56.08 
 
 		 256 aa  294  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0156  exodeoxyribonuclease III  53.33 
 
 		 259 aa  285  7e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  49.81 
 
 		 261 aa  261  8.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  49.62 
 
 		 267 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  50 
 
 		 266 aa  254  8e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  49.24 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  51.91 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  48.86 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  51.35 
 
 		 259 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  50.97 
 
 		 259 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  50.19 
 
 		 259 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  48.13 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  50.97 
 
 		 259 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  50 
 
 		 261 aa  248  8e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  46.18 
 
 		 263 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  49.06 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1784  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 266 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144543  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  49.25 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1683  exodeoxyribonuclease III  49.62 
 
 		 258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  46.95 
 
 		 263 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  48.87 
 
 		 264 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  49.25 
 
 		 264 aa  241  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  49.24 
 
 		 270 aa  239  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  47.49 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  47.53 
 
 		 262 aa  235  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  47.49 
 
 		 258 aa  235  7e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0897  exodeoxyribonuclease III  45.56 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  45.56 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  45.21 
 
 		 279 aa  229  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  45.7 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  44.06 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  46.48 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  45.83 
 
 		 262 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  43.56 
 
 		 263 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2921  exodeoxyribonuclease III Xth  47.37 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  45.1 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  43.24 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0660  exodeoxyribonuclease III  42.69 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969043  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0692  exodeoxyribonuclease III  42.69 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000190547  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  45.45 
 
 		 262 aa  214  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  45.88 
 
 		 256 aa  211  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  41.54 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0446  exodeoxyribonuclease III Xth  44.36 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  40.61 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  41.63 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  38.43 
 
 		 254 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  37.16 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  36.7 
 
 		 277 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  37.16 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  37.59 
 
 		 275 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  38.76 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  41.47 
 
 		 254 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  37.59 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  39.84 
 
 		 254 aa  185  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  38.37 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  38.37 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  38.37 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  38.37 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  38.37 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  38.19 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  38.37 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  38.37 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  38.02 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5653  exodeoxyribonuclease III Xth  41.6 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.248061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  37.6 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  37.21 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>