43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5027 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 414 aa  790    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  57.28 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  53.75 
 
 		 399 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 405 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 405 aa  279  5e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  48.52 
 
 		 423 aa  276  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 411 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  41.56 
 
 		 415 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  43.01 
 
 		 400 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  39.44 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 408 aa  179  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  37.28 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  35.68 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 400 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 420 aa  156  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 		 401 aa  156  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 391 aa  154  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 417 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 400 aa  126  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 410 aa  57  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  30.9 
 
 		 491 aa  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  31.13 
 
 		 456 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.25 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 434 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 460 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 450 aa  43.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 504 aa  43.1  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>