More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4309 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 301 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  93.02 
 
 		 301 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  71.67 
 
 		 296 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.33 
 
 		 298 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.11 
 
 		 299 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.45 
 
 		 305 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.45 
 
 		 305 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  60.14 
 
 		 287 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  54.15 
 
 		 319 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  53.49 
 
 		 319 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  57.49 
 
 		 309 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  52.15 
 
 		 319 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  51.83 
 
 		 331 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  51.83 
 
 		 310 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  51.83 
 
 		 331 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  51.5 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  51.2 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  51.83 
 
 		 312 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  50.99 
 
 		 311 aa  228  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  50.83 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  51.92 
 
 		 268 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  51.92 
 
 		 268 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  51.92 
 
 		 268 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  51.25 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3416  hypothetical protein  54.45 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.21 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  33.66 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.94 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  33.87 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  33.87 
 
 		 302 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  33.54 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  33.75 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  33.44 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  33.44 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  33.44 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  33.77 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  32.57 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  32.57 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  38.99 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  33.67 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  32.23 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  35.92 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  32.13 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  33.22 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  31.29 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.8 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  34.49 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  28.72 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  32.27 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  27.57 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  27.57 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  29.24 
 
 		 315 aa  99  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  26.3 
 
 		 304 aa  96.3  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  30.07 
 
 		 320 aa  95.5  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  31.87 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  31.01 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  30.97 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  30.5 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  27.34 
 
 		 313 aa  85.9  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.9 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  29.35 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  30.93 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.45 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  28.25 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  26.67 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.58 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  27.27 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  23.49 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  26.89 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  23.13 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  26.89 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  23.41 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  26.89 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.86 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  26.89 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  26.52 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.35 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  26.52 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  26.89 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  26.89 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  26.89 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  26.59 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  27.27 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  31.49 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.38 
 
 		 397 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  23.67 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  31.27 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  30.77 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  27.47 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30.31 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  29.97 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  25.1 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  26.96 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  28.05 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>