92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7135 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  58.52 
 
 		 471 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  58.21 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  58.87 
 
 		 463 aa  158  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  58.52 
 
 		 459 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  58.59 
 
 		 421 aa  155  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  54.07 
 
 		 444 aa  147  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  56.3 
 
 		 421 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  53.33 
 
 		 444 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  59.06 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  53.15 
 
 		 411 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  53.33 
 
 		 425 aa  141  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  56.25 
 
 		 452 aa  141  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  56.25 
 
 		 452 aa  141  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  56.25 
 
 		 452 aa  141  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  56.25 
 
 		 448 aa  141  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  56.25 
 
 		 448 aa  141  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  53.24 
 
 		 435 aa  138  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  49.69 
 
 		 200 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  46.43 
 
 		 203 aa  136  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  52.17 
 
 		 464 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  47.33 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  51.19 
 
 		 459 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  42.94 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  59.05 
 
 		 441 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  55.75 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  53.33 
 
 		 421 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  50 
 
 		 178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  60 
 
 		 447 aa  124  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  39.76 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  47.79 
 
 		 212 aa  121  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  45.16 
 
 		 436 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  43.44 
 
 		 396 aa  112  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  53.54 
 
 		 488 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  55.29 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  36.55 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  41.48 
 
 		 410 aa  101  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  59.74 
 
 		 131 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  59.21 
 
 		 77 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  37.04 
 
 		 408 aa  95.9  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  36.69 
 
 		 684 aa  95.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  37.69 
 
 		 409 aa  93.6  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  40.3 
 
 		 470 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  35.58 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  49.35 
 
 		 403 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  30.66 
 
 		 411 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  40.54 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  40.54 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  27.21 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  27.13 
 
 		 411 aa  62.4  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.28 
 
 		 413 aa  61.2  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  28.28 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.76 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.53 
 
 		 483 aa  57.8  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  30.71 
 
 		 432 aa  57  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  28.48 
 
 		 417 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3667  parB-like partition protein  33.07 
 
 		 293 aa  46.2  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  40.58 
 
 		 309 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1149  ParB domain protein nuclease  34.33 
 
 		 422 aa  44.7  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3163  parB-like partition protein  28.95 
 
 		 352 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1156  ParB domain protein nuclease  31.25 
 
 		 442 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.28535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  26.32 
 
 		 297 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3718  ParB domain protein nuclease  31.3 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  39.71 
 
 		 279 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  39.71 
 
 		 279 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  36.99 
 
 		 298 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0563  ParB domain protein nuclease  30.21 
 
 		 462 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  27 
 
 		 607 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  26.32 
 
 		 290 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  26.32 
 
 		 290 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  26.32 
 
 		 290 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  26.32 
 
 		 290 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  33.55 
 
 		 292 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  26.32 
 
 		 290 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  26.32 
 
 		 290 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  41.43 
 
 		 288 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  26.32 
 
 		 290 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3104  ParB domain protein nuclease  29.59 
 
 		 457 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  27.32 
 
 		 281 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  32.43 
 
 		 312 aa  42.4  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  28.02 
 
 		 290 aa  42.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  41.18 
 
 		 269 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  39.39 
 
 		 401 aa  42  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  30 
 
 		 281 aa  42  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  26.32 
 
 		 290 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  26.32 
 
 		 290 aa  42  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  26.32 
 
 		 290 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  34.25 
 
 		 293 aa  41.6  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2024  parB-like partition protein  32.86 
 
 		 286 aa  41.2  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000382297  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  27.59 
 
 		 278 aa  40.8  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  27.59 
 
 		 278 aa  40.8  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  27.59 
 
 		 278 aa  40.8  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>