More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6462 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  83.33 
 
 
284 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  81.34 
 
 
284 aa  484  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  77.82 
 
 
281 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  76.6 
 
 
283 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  72.04 
 
 
290 aa  427  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  68.33 
 
 
297 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  64.96 
 
 
289 aa  371  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  63.74 
 
 
639 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  63.64 
 
 
293 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  62.23 
 
 
296 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  62.18 
 
 
293 aa  355  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  60.57 
 
 
308 aa  355  5e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  58.72 
 
 
336 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  58.72 
 
 
296 aa  350  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  58.01 
 
 
296 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  57.24 
 
 
336 aa  349  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  58.24 
 
 
356 aa  345  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  58.36 
 
 
334 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  56.54 
 
 
311 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  58.42 
 
 
323 aa  341  8e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  58.66 
 
 
321 aa  341  9e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  57.24 
 
 
323 aa  334  7.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  56.58 
 
 
321 aa  330  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  56.38 
 
 
337 aa  329  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  54.45 
 
 
329 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  50.49 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  51.96 
 
 
324 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  53.62 
 
 
296 aa  311  9e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  52.33 
 
 
283 aa  308  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  55.87 
 
 
289 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  54.74 
 
 
294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  50.89 
 
 
300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  51.08 
 
 
323 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  53.36 
 
 
300 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  52.46 
 
 
296 aa  295  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  50.72 
 
 
374 aa  294  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  53 
 
 
290 aa  294  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  50.35 
 
 
309 aa  289  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  47.37 
 
 
303 aa  288  7e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  46.67 
 
 
306 aa  279  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  47.69 
 
 
323 aa  277  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  48.39 
 
 
288 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  49.82 
 
 
287 aa  275  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  47.16 
 
 
301 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  50.7 
 
 
293 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  49.47 
 
 
290 aa  271  9e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  49.47 
 
 
290 aa  271  9e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  49.47 
 
 
290 aa  271  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  48.94 
 
 
291 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  47.22 
 
 
305 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  44.33 
 
 
303 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  43.58 
 
 
313 aa  238  1e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  39.86 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  41.2 
 
 
290 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  39.72 
 
 
297 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 
296 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
289 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  37.59 
 
 
297 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  48.92 
 
 
409 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  67.74 
 
 
99 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
282 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  29.43 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  30.14 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  24.83 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  28.91 
 
 
307 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  29.47 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3408  hypothetical protein  51.43 
 
 
80 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337254  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0197  alpha/beta hydrolase fold protein  25.34 
 
 
280 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  39.68 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  42.34 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  35.38 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  42.34 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  28.17 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  40.2 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  34.15 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  34.15 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  28.42 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  41.28 
 
 
301 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  38.02 
 
 
299 aa  79  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  26.88 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  35.65 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>