196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3035 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  100 
 
 		 382 aa  740    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  67.95 
 
 		 377 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3977  transporter, putative  68.22 
 
 		 377 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  65.93 
 
 		 376 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0186  transporter, putative  67.95 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0404913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  64.54 
 
 		 376 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  64.36 
 
 		 378 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  64.54 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4051  transporter, putative  68.22 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2948  transporter, putative  67.67 
 
 		 383 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  64.27 
 
 		 377 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3363  putative transporter  67.95 
 
 		 377 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1595  putative transporter  67.95 
 
 		 377 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3007  putative transporter  67.95 
 
 		 377 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  65.1 
 
 		 376 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  65.1 
 
 		 376 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  48.48 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  48.48 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  46.88 
 
 		 408 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  42.13 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  42.6 
 
 		 369 aa  247  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  40.5 
 
 		 366 aa  246  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  42.98 
 
 		 372 aa  243  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  42.98 
 
 		 372 aa  243  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  42.98 
 
 		 372 aa  243  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  42.98 
 
 		 372 aa  243  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  42.98 
 
 		 372 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  42.69 
 
 		 372 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  42.69 
 
 		 372 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  42.69 
 
 		 372 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  48.8 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  42.98 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0904  citrate transporter family protein  39.12 
 
 		 370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0876  citrate transporter family protein  38.84 
 
 		 370 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0934  citrate transporter family protein  38.84 
 
 		 370 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0967  citrate transporter family protein  38.84 
 
 		 370 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1354  Citrate transporter  38.37 
 
 		 367 aa  173  5.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0783517  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13780  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  34.42 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2095  putative transporter  25.85 
 
 		 383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3520  Citrate transporter  30.86 
 
 		 374 aa  133  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000961964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  26.56 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  26.17 
 
 		 383 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  26.17 
 
 		 383 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2909  transporter  26.39 
 
 		 383 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.204967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3166  putative transporter  26.39 
 
 		 383 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3173  putative transporter  27.37 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.745852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2859  transporter  25.59 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.265572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3129  citrate transporter  30.81 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.246897  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0077  di- and tricarboxylate transporter  26.56 
 
 		 368 aa  113  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154883  normal  0.998926 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0595  di- and tricarboxylate transporter  29 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1874  citrate transporter  29.17 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870467  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0236  Citrate transporter  30.43 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0898  putative di-/tri-carboxylate transporter  28.53 
 
 		 395 aa  97.4  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.878085  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  27.91 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  29.41 
 
 		 414 aa  96.3  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1042  citrate transporter  28.23 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  28.14 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  28.57 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  29.36 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  31.9 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  28.73 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  28.57 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1949  di- or tricarboxylate transporter  27.38 
 
 		 392 aa  86.3  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00031029  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  27.78 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  26.92 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  25.36 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  27.44 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  26.4 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  27.96 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  22.16 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  29.27 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  29.77 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  27.42 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  27.69 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  27.67 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  25.38 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  24.48 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  30.57 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  25.93 
 
 		 577 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  29.17 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  29.3 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  29.94 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  25.45 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  25.75 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  25.9 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  28.36 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  25.87 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  30.06 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  24.59 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  26.5 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  25.78 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  25.96 
 
 		 421 aa  72.8  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  23.36 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  23.61 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  24.58 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  25.68 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  25.54 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  23.6 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  23.89 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  23.42 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>