193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1509 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
181 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  80.11 
 
 
196 aa  293  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  81.36 
 
 
190 aa  273  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  72.19 
 
 
187 aa  258  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  79.1 
 
 
190 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  67.05 
 
 
185 aa  250  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  67.05 
 
 
185 aa  248  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  70.24 
 
 
177 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  69.64 
 
 
177 aa  240  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  65.29 
 
 
176 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  65.88 
 
 
191 aa  237  8e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  65.87 
 
 
168 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  64.71 
 
 
176 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  64.71 
 
 
176 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  64.67 
 
 
180 aa  233  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  63.69 
 
 
179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  63.16 
 
 
181 aa  229  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  63.25 
 
 
176 aa  223  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  58.24 
 
 
174 aa  214  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  59.54 
 
 
192 aa  213  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  59.28 
 
 
181 aa  208  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  59.28 
 
 
181 aa  208  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  61.39 
 
 
186 aa  205  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  59.64 
 
 
184 aa  204  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  58.24 
 
 
186 aa  203  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  53.41 
 
 
194 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  55.62 
 
 
257 aa  184  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  45.86 
 
 
187 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  38.3 
 
 
182 aa  95.5  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  36.24 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  35.62 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  33.56 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  34.48 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  33.56 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  34.29 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  33.56 
 
 
164 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  35.25 
 
 
138 aa  80.5  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  34.25 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  33.57 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  32.88 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  30.34 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  32.19 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  32.19 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  34.51 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  32.12 
 
 
160 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  32.33 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5727  Ferritin Dps family protein  28.87 
 
 
157 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517178  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2408  Ferritin Dps family protein  26.76 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  33.83 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  32.59 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  32.33 
 
 
161 aa  57.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  31.58 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  30.43 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  30.41 
 
 
161 aa  55.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  33.08 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  31.39 
 
 
160 aa  55.5  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1742  Ferritin and Dps  27.46 
 
 
154 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  29.41 
 
 
160 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  31.88 
 
 
275 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1400  Ferritin and Dps  28.87 
 
 
154 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  29.37 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2460  hypothetical protein  24.65 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2317  hypothetical protein  24.65 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  31.11 
 
 
159 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0415  Ferritin Dps family protein  28.77 
 
 
142 aa  52  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  30.08 
 
 
161 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  28.15 
 
 
157 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  30.6 
 
 
158 aa  52.4  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  30.08 
 
 
161 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  30.37 
 
 
161 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  30.08 
 
 
159 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  30.08 
 
 
161 aa  51.6  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  30.08 
 
 
154 aa  51.6  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  31.34 
 
 
161 aa  51.2  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4256  Ferritin Dps family protein  26.76 
 
 
144 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4317  Ferritin Dps family protein  26.76 
 
 
144 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000113171  hitchhiker  0.0023195 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  31.34 
 
 
161 aa  51.2  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  31.11 
 
 
161 aa  51.2  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  30.37 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  31.39 
 
 
155 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2388  Ferritin and Dps  29.73 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5224  Ferritin Dps family protein  30.99 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  28.57 
 
 
159 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  32.33 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  30.08 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  30.37 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  30.08 
 
 
154 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  31.11 
 
 
161 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0243  bacterioferritin  28.57 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1894  Ferritin and Dps  29.71 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184014 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  30.08 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  27.82 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  30.6 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  30.08 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  30.94 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  32.84 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  28.57 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  27.82 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  30.37 
 
 
161 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  30.6 
 
 
172 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>