134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1428 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  75.13 
 
 
200 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  70.41 
 
 
199 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  68.23 
 
 
200 aa  258  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  68.75 
 
 
200 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  68.23 
 
 
200 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  68.23 
 
 
200 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  67.01 
 
 
205 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  67.01 
 
 
205 aa  256  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  67.71 
 
 
200 aa  254  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  67.91 
 
 
205 aa  254  7e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  67.91 
 
 
205 aa  254  7e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  67.91 
 
 
205 aa  254  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  67.91 
 
 
205 aa  254  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  68.75 
 
 
200 aa  254  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  66.31 
 
 
205 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  67.91 
 
 
187 aa  249  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  68.23 
 
 
200 aa  247  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  69.54 
 
 
188 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  67.82 
 
 
188 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  65.52 
 
 
190 aa  214  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  58.05 
 
 
209 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  56.84 
 
 
191 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  57.56 
 
 
207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  58.06 
 
 
195 aa  189  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  56.32 
 
 
194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  56.02 
 
 
191 aa  188  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  57.78 
 
 
212 aa  187  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  55.61 
 
 
189 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  54.35 
 
 
190 aa  178  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  54.35 
 
 
194 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  55.09 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  53.48 
 
 
195 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  51.37 
 
 
195 aa  167  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  51.85 
 
 
192 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  52.02 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  50.3 
 
 
177 aa  155  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  51.85 
 
 
173 aa  153  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  33.94 
 
 
173 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  45.3 
 
 
183 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  39.04 
 
 
176 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  40.74 
 
 
174 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  41.13 
 
 
174 aa  98.6  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  44.83 
 
 
175 aa  98.2  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  38.78 
 
 
174 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  43.48 
 
 
174 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  38.13 
 
 
177 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  36.05 
 
 
181 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  36.05 
 
 
181 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  36.05 
 
 
181 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  36.05 
 
 
181 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  33.57 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  37.42 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  37.42 
 
 
168 aa  82  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  36.5 
 
 
195 aa  82  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  38.14 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  37.76 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  38.04 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  36.42 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  32.37 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  36.09 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  34.44 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  35.25 
 
 
183 aa  71.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  39.39 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  39.39 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  34.48 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  31.09 
 
 
276 aa  65.1  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  36.52 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  32.67 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
182 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  33.8 
 
 
190 aa  58.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  33.8 
 
 
190 aa  58.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  34.65 
 
 
177 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  31.21 
 
 
189 aa  58.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  24.68 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  24.84 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  24.84 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  24.05 
 
 
201 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29824  predicted protein  30.63 
 
 
358 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  35.17 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  23.3 
 
 
199 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  25 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  33.33 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13140  hypothetical protein  30.28 
 
 
200 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225832 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  32.12 
 
 
207 aa  48.1  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3284  hypothetical protein  35.38 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3800  hypothetical protein  35.16 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  30.29 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  31.01 
 
 
195 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  28.03 
 
 
198 aa  46.2  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4460  hypothetical protein  33.85 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3906  hypothetical protein  33.85 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13353  methyltransferase  32.28 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.356592  normal  0.242787 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3621  hypothetical protein  33.85 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>