236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0711 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  100 
 
 
336 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  86.35 
 
 
338 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  87.5 
 
 
339 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  74.4 
 
 
343 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2375  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  70.5 
 
 
336 aa  477  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280043  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0460  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  74.7 
 
 
340 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3020  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  74.7 
 
 
340 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  74.7 
 
 
381 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0978  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  74.7 
 
 
381 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2915  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  74.7 
 
 
340 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2975  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  74.7 
 
 
340 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0169  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  74.7 
 
 
381 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  69.49 
 
 
682 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  69.49 
 
 
682 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0979  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  69.49 
 
 
334 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0580619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0896  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  68.69 
 
 
334 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0884  hypothetical protein  68.69 
 
 
334 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4132  hypothetical protein  70.03 
 
 
336 aa  448  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  49.38 
 
 
344 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  48.59 
 
 
330 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  47.65 
 
 
331 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  50.32 
 
 
342 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1924  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  49.22 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170465  normal  0.258839 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  40.45 
 
 
275 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  40.85 
 
 
289 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3718  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.92 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0858  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.31 
 
 
341 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.82 
 
 
268 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2550  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  56.14 
 
 
211 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.748335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0730  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  57.32 
 
 
220 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3884  putative dehydrogenase  57.42 
 
 
200 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0795  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  58.06 
 
 
188 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.06408  normal  0.122014 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0713  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  56.69 
 
 
220 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0806  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  57.32 
 
 
222 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0350  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  57.32 
 
 
222 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0695464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0834  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  57.32 
 
 
222 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3926  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  56.69 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.672266  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.2 
 
 
278 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2420  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  57.69 
 
 
196 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.245646  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  37.14 
 
 
327 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  39.03 
 
 
295 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  51.85 
 
 
255 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  38.11 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.71 
 
 
274 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.69 
 
 
294 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1153  hypothetical protein  36.07 
 
 
290 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  43.1 
 
 
276 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  46.71 
 
 
281 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  46.99 
 
 
281 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  43.18 
 
 
285 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  48.45 
 
 
279 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  46.39 
 
 
281 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  47.2 
 
 
291 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  43.68 
 
 
280 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  45.78 
 
 
281 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  45.51 
 
 
279 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.22 
 
 
285 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  45.51 
 
 
279 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.86 
 
 
280 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0497  molybdenum cofactor sulfurylase  39.24 
 
 
311 aa  142  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3322  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.33 
 
 
267 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1337  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  45.06 
 
 
470 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.24 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.98 
 
 
267 aa  136  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0224  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.47 
 
 
287 aa  135  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0366707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3136  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.62 
 
 
271 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2960  putative xanthine dehydrogenase accessory protein  37.33 
 
 
320 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  31.9 
 
 
283 aa  122  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  38.01 
 
 
309 aa  122  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  31.46 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2864  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.1 
 
 
271 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3946  hypothetical protein  39.06 
 
 
313 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.055113  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_004310  BR0351  chaperone XdhC, putative  32.07 
 
 
248 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3556  molybdenum cofactor sulfurylase  38.82 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3239  hypothetical protein  39.06 
 
 
313 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.82 
 
 
283 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  42.35 
 
 
288 aa  115  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  40.61 
 
 
280 aa  115  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  40.82 
 
 
313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1142  hypothetical protein  28.09 
 
 
328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.722084  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.77 
 
 
288 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.26 
 
 
279 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  26.65 
 
 
353 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  27.15 
 
 
351 aa  89.7  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  29.09 
 
 
381 aa  89.7  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  31.27 
 
 
382 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  30.03 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  35.48 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.8 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2411  protein of unknown function DUF182  30.07 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0780  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  30.6 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0923  protein of unknown function DUF182  30.6 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  36 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6767  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor XdhC/CoxF family-like protein  25.87 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  26.18 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  28.03 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  24.32 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  38.82 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  43.43 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  26.8 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>