More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2534 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 891 aa  671    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  38.94 
 
 		 956 aa  647    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  42.18 
 
 		 936 aa  739    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  40.08 
 
 		 934 aa  648    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  39.23 
 
 		 896 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 896 aa  649    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  37.83 
 
 		 924 aa  643    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 929 aa  662    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  40.55 
 
 		 893 aa  665    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  38.44 
 
 		 892 aa  653    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  38.92 
 
 		 931 aa  658    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  38.52 
 
 		 930 aa  647    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  40.55 
 
 		 893 aa  664    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  39.44 
 
 		 891 aa  670    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  39.14 
 
 		 892 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  39.14 
 
 		 892 aa  656    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  38.4 
 
 		 928 aa  651    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  100 
 
 		 926 aa  1882    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  38.66 
 
 		 926 aa  650    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 929 aa  660    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  37.29 
 
 		 888 aa  637    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  37.47 
 
 		 892 aa  649    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  38.01 
 
 		 892 aa  649    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  39.4 
 
 		 916 aa  658    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  38.13 
 
 		 932 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  38.44 
 
 		 951 aa  658    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  38.93 
 
 		 949 aa  647    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  38.13 
 
 		 932 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  39.14 
 
 		 939 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  38.13 
 
 		 932 aa  637    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  37.65 
 
 		 893 aa  646    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 921 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  36.67 
 
 		 903 aa  635  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  38.94 
 
 		 921 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  37.98 
 
 		 903 aa  634  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  39.05 
 
 		 935 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  39.35 
 
 		 946 aa  632  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  38.14 
 
 		 922 aa  633  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  38.06 
 
 		 946 aa  633  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  38.79 
 
 		 922 aa  633  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  38.02 
 
 		 934 aa  630  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  37.19 
 
 		 945 aa  629  1e-179  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  39.26 
 
 		 921 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  38.79 
 
 		 918 aa  628  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  38.23 
 
 		 933 aa  624  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  38.36 
 
 		 928 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  38.36 
 
 		 928 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  38.26 
 
 		 928 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  38.15 
 
 		 921 aa  624  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  38.28 
 
 		 928 aa  622  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  38.36 
 
 		 928 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  38.22 
 
 		 922 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  38.62 
 
 		 918 aa  625  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  38.36 
 
 		 928 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  37.88 
 
 		 928 aa  621  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  37.88 
 
 		 928 aa  621  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  37.88 
 
 		 928 aa  621  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  37.88 
 
 		 928 aa  621  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  36.16 
 
 		 924 aa  621  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  39.89 
 
 		 896 aa  621  1e-176  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  37.88 
 
 		 928 aa  621  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  37.88 
 
 		 928 aa  621  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  37.88 
 
 		 928 aa  621  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  37.82 
 
 		 922 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  37.88 
 
 		 928 aa  621  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  38.51 
 
 		 945 aa  619  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  37.7 
 
 		 923 aa  622  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  37.82 
 
 		 922 aa  617  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  37.78 
 
 		 928 aa  618  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  38.2 
 
 		 939 aa  617  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  38.18 
 
 		 943 aa  617  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  37.65 
 
 		 928 aa  618  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  36.65 
 
 		 912 aa  619  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  37.22 
 
 		 931 aa  616  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  36.96 
 
 		 939 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  37.15 
 
 		 963 aa  615  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  37.29 
 
 		 936 aa  615  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0558  DNA polymerase I superfamily protein  39.32 
 
 		 908 aa  615  9.999999999999999e-175  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.101615  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  38.47 
 
 		 945 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  37.26 
 
 		 944 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  38.65 
 
 		 950 aa  614  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  39.29 
 
 		 894 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  38.11 
 
 		 936 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  36.67 
 
 		 911 aa  614  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  37.81 
 
 		 930 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  35.67 
 
 		 926 aa  609  1e-173  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  36.63 
 
 		 906 aa  612  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  37.77 
 
 		 928 aa  609  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  37.07 
 
 		 934 aa  610  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  37.04 
 
 		 908 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 932 aa  607  9.999999999999999e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  39.21 
 
 		 898 aa  608  9.999999999999999e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 930 aa  604  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  37.53 
 
 		 915 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  36.43 
 
 		 917 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  36.43 
 
 		 913 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  35.25 
 
 		 957 aa  604  1.0000000000000001e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  36.78 
 
 		 930 aa  602  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  37.98 
 
 		 930 aa  600  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 915 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>