69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6288 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 
313 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2761  copper resistance protein D  70.51 
 
 
313 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  70.19 
 
 
313 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4099  copper resistance D domain-containing protein  70.51 
 
 
313 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.441252 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4750  copper resistance D  70.83 
 
 
313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3417  copper resistance D domain-containing protein  70.83 
 
 
313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  66.13 
 
 
314 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  69.51 
 
 
306 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1956  copper resistance protein, putative  67.83 
 
 
315 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  66.13 
 
 
314 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  66.45 
 
 
315 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2037  copper resistance D domain-containing protein  63.14 
 
 
313 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  52.72 
 
 
314 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  52.72 
 
 
314 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  32.34 
 
 
364 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2696  copper resistance D domain-containing protein  38.84 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5995  copper resistance D  39.38 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2720  copper resistance D domain-containing protein  37.96 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2592  copper resistance D domain-containing protein  37.96 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2056  copper resistance D  38.39 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2667  copper resistance D domain-containing protein  38.39 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0630  copper resistance D domain-containing protein  36.89 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2695  putative copper resistance protein  36.18 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2382  putative copper resistance protein  36.18 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0739  copper resistance family protein  36.18 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0751  copper resistance family protein  36.18 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2463  putative copper resistance protein  36.18 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0917  putative transmembrane transporter protein  36.18 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804185  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0252  copper resistance protein, putative  36.18 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0431  copper resistance D domain-containing protein  32.23 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.121113  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0610  copper resistance protein, putative  38.79 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  31.56 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  31.56 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  31.56 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3306  copper resistance D domain protein  30.1 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  30.38 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  31.38 
 
 
310 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  28.48 
 
 
560 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  26.32 
 
 
316 aa  52.8  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  28.62 
 
 
309 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0653  putative copper-resistance transporter, CopD  29.77 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.819488  normal  0.721895 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  29.47 
 
 
305 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  32.68 
 
 
578 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  27.5 
 
 
400 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  27.21 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  29.85 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  27.55 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.89 
 
 
731 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  30.17 
 
 
291 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  30.17 
 
 
291 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  30.17 
 
 
291 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  30.17 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  30.17 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  28.97 
 
 
718 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  31.41 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  25.71 
 
 
686 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  23.81 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  23.81 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  26.95 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  28.4 
 
 
571 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  23.81 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  23.81 
 
 
290 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  23.81 
 
 
290 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  30.53 
 
 
565 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  23.81 
 
 
290 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  23.28 
 
 
290 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  25.71 
 
 
718 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  32.03 
 
 
287 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  22.56 
 
 
439 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>