60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6162 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  897    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  97.95 
 
 		 438 aa  879    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  96.58 
 
 		 438 aa  869    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  96.58 
 
 		 438 aa  869    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  97.95 
 
 		 438 aa  879    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  96.8 
 
 		 438 aa  872    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  96.58 
 
 		 438 aa  869    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  47.95 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  47.95 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4244  initiator RepB protein  39.11 
 
 		 433 aa  279  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5513  initiator RepB protein  35.98 
 
 		 431 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  34.24 
 
 		 440 aa  270  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5084  initiator RepB protein  32.3 
 
 		 419 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3108  hypothetical protein  33.56 
 
 		 454 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754423  normal  0.245569 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4967  hypothetical protein  33.56 
 
 		 487 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131096  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4541  hypothetical protein  34.47 
 
 		 455 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5695  hypothetical protein  34.47 
 
 		 455 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18908  hitchhiker  0.00131536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5164  hypothetical protein  34.47 
 
 		 455 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3160  hypothetical protein  34.32 
 
 		 454 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7009  putative replication protein  33.72 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643395  normal  0.034808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0003  hypothetical protein  33.49 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4153  putative replication protein  32.88 
 
 		 449 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3026  putative replication protein  33.86 
 
 		 460 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1505  plasmid replication protein, putative  31.82 
 
 		 483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2117  putative plasmid replication protein  31.82 
 
 		 483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0976638  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2412  putative replication protein  31.82 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3178  putative replication protein  31.82 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29665  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3291  replication protein  31.82 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0254178  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1425  putative plasmid replication protein  31.82 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47169  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1145  putative plasmid replication protein  31.82 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00334434  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2373  plasmid replication protein, putative  31.75 
 
 		 484 aa  183  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0755761  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  30.51 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  31.7 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6107  putative replication protein  26.03 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  31.19 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  30.87 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  28.79 
 
 		 447 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  30.22 
 
 		 437 aa  123  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  30.22 
 
 		 437 aa  123  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  28.98 
 
 		 429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  29.02 
 
 		 433 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  25.32 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0080  hypothetical protein  23.81 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00491094 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4998  hypothetical protein  26.09 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4356  hypothetical protein  23.97 
 
 		 505 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  24.25 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4694  initiator RepB protein  22.05 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.251303  normal  0.0571299 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6161  hypothetical protein  25.68 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1368  hypothetical protein  20.82 
 
 		 467 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7550  hypothetical protein  24.9 
 
 		 468 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0539353 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  24.07 
 
 		 445 aa  53.5  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1802  hypothetical protein  24.81 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2773  hypothetical protein  21.96 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5034  initiator RepB protein  23.25 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6574  hypothetical protein  25.79 
 
 		 465 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.478836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4938  initiator RepB protein  20.44 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  0.519061 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  28.57 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  28.45 
 
 		 331 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  28.87 
 
 		 219 aa  43.9  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  29.57 
 
 		 233 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>