54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1053 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  319  9.000000000000001e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  88.68 
 
 
159 aa  269  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  87.88 
 
 
165 aa  256  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  86.67 
 
 
165 aa  251  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  86.67 
 
 
165 aa  251  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  90.26 
 
 
165 aa  248  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  90.26 
 
 
165 aa  248  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  78.38 
 
 
171 aa  227  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  71.7 
 
 
165 aa  223  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  73.12 
 
 
165 aa  206  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  57.05 
 
 
174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  77.65 
 
 
222 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  76.83 
 
 
225 aa  124  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  50 
 
 
174 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  53.69 
 
 
161 aa  120  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  52.7 
 
 
179 aa  120  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  51.77 
 
 
174 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  76.71 
 
 
210 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  76.71 
 
 
210 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  76.71 
 
 
210 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  76.71 
 
 
210 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  76.71 
 
 
210 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  45.19 
 
 
142 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  38.01 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  43.08 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  37.82 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  39.57 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  44.44 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  41.67 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  39.39 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  39.39 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  37.24 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  38.4 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  37.04 
 
 
161 aa  61.6  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  30.77 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  34.78 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  33.1 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  35.48 
 
 
138 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  37.04 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  35.83 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  29.5 
 
 
146 aa  50.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  30 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  33.05 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  30.08 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  33.1 
 
 
144 aa  45.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  31.21 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  30.28 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  32.23 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  30.77 
 
 
137 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  31.94 
 
 
139 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  31.94 
 
 
139 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  27.87 
 
 
139 aa  41.2  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  29.66 
 
 
147 aa  40.8  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>