183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0557 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  57.94 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  53.55 
 
 		 218 aa  235  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  54.03 
 
 		 218 aa  234  9e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  59.52 
 
 		 216 aa  231  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  54.93 
 
 		 219 aa  231  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  53.55 
 
 		 218 aa  231  8.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  59.35 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  58.99 
 
 		 216 aa  225  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  54.72 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  58.22 
 
 		 220 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  52.11 
 
 		 223 aa  219  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  55.87 
 
 		 219 aa  218  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  53.77 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  58.96 
 
 		 216 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  50.23 
 
 		 232 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  51.43 
 
 		 218 aa  204  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  52.15 
 
 		 216 aa  204  9e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  52.38 
 
 		 219 aa  197  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  51.87 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  48.84 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  50.46 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  48.31 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  46.92 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  46.45 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  48.58 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  47.37 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  49.07 
 
 		 217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  50.47 
 
 		 222 aa  158  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  50.47 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  46.19 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  46.41 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  44.29 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  45.69 
 
 		 226 aa  131  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  43.43 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  40.8 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  40.48 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  39.68 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  49.02 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  42.86 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  43.65 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  46.08 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  45.1 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  46.08 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  33.33 
 
 		 260 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  35.38 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  31.21 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  32.31 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  32.39 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  33.1 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  37.12 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  30.77 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.08 
 
 		 328 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  32.39 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.93 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.71 
 
 		 286 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.41 
 
 		 300 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.61 
 
 		 295 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.38 
 
 		 304 aa  52.8  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 305 aa  52.4  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  34.52 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.67 
 
 		 296 aa  52  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  35.71 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.73 
 
 		 506 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  29.08 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.53 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.53 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 302 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  34.52 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.46 
 
 		 299 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.02 
 
 		 294 aa  49.3  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  33.62 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 300 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 300 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 300 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 300 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 300 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 300 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.6 
 
 		 299 aa  48.5  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.21 
 
 		 318 aa  48.9  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.1 
 
 		 315 aa  48.5  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  56.52 
 
 		 287 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.17 
 
 		 307 aa  48.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.48 
 
 		 300 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.02 
 
 		 295 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.76 
 
 		 299 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 		 306 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  49.21 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.7 
 
 		 296 aa  47  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  34.23 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.85 
 
 		 300 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.02 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.92 
 
 		 296 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>