More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27250 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_27250  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 626 aa  1233    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  53.06 
 
 		 614 aa  622  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  51.72 
 
 		 615 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  54.3 
 
 		 600 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3978  ABC transporter related protein  51.81 
 
 		 590 aa  599  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1445  ABC transporter-like protein  53.4 
 
 		 609 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2929  ABC transporter related protein  53.18 
 
 		 590 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  0.358264 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3033  ABC transporter related  51.58 
 
 		 602 aa  570  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5717  ABC transporter related  52.75 
 
 		 620 aa  568  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  48.77 
 
 		 593 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1494  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 595 aa  543  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.648483  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2230  ABC transporter related  48.78 
 
 		 593 aa  538  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3227  ABC transporter related protein  52.69 
 
 		 609 aa  531  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.393011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.52 
 
 		 635 aa  531  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.464481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.67 
 
 		 618 aa  526  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.479998  normal  0.0267692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3180  ABC transporter related  49.34 
 
 		 589 aa  524  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1926  ABC transporter related  51.36 
 
 		 588 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4361  ABC transporter related  49 
 
 		 581 aa  491  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1210  ABC transporter related  45.71 
 
 		 615 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1994  ABC transporter related protein  48.8 
 
 		 616 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  31.58 
 
 		 587 aa  297  5e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  34.48 
 
 		 605 aa  283  9e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  33.85 
 
 		 610 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  33.85 
 
 		 610 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  33.85 
 
 		 610 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  39.36 
 
 		 984 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.78 
 
 		 567 aa  278  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.95 
 
 		 567 aa  277  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  34.58 
 
 		 606 aa  277  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  31.02 
 
 		 588 aa  273  8.000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.43 
 
 		 597 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  33.79 
 
 		 619 aa  270  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  31.84 
 
 		 636 aa  270  5.9999999999999995e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.46 
 
 		 608 aa  268  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  32.85 
 
 		 614 aa  266  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  32.13 
 
 		 615 aa  265  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  34.12 
 
 		 611 aa  266  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  32.63 
 
 		 596 aa  265  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  32.18 
 
 		 596 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  31.26 
 
 		 600 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.39 
 
 		 567 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.05 
 
 		 618 aa  260  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  30.58 
 
 		 618 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  34.2 
 
 		 566 aa  260  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  34.55 
 
 		 1284 aa  259  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  33.81 
 
 		 606 aa  258  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  31.97 
 
 		 617 aa  258  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  32.84 
 
 		 608 aa  257  5e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.41 
 
 		 587 aa  256  8e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.01 
 
 		 1257 aa  256  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  32.36 
 
 		 576 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  34.49 
 
 		 1301 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  31.67 
 
 		 572 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  29.05 
 
 		 598 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.97 
 
 		 571 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  30.24 
 
 		 572 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  29.6 
 
 		 582 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  31.96 
 
 		 608 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  28.72 
 
 		 580 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  33.22 
 
 		 652 aa  254  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  30.92 
 
 		 575 aa  254  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  33.57 
 
 		 619 aa  253  7e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  30.29 
 
 		 609 aa  253  8.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  31.02 
 
 		 590 aa  253  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  35.21 
 
 		 620 aa  252  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.63 
 
 		 579 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  32.37 
 
 		 627 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  33.91 
 
 		 634 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  32.06 
 
 		 602 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  30.17 
 
 		 584 aa  251  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  33.27 
 
 		 613 aa  251  4e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.77 
 
 		 571 aa  250  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  35.46 
 
 		 582 aa  250  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  30.57 
 
 		 571 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.57 
 
 		 571 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  35.46 
 
 		 603 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.57 
 
 		 571 aa  249  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.57 
 
 		 571 aa  249  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.57 
 
 		 571 aa  249  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.57 
 
 		 571 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  32.4 
 
 		 603 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  33.87 
 
 		 625 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.43 
 
 		 634 aa  249  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  33.1 
 
 		 602 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  33.15 
 
 		 623 aa  248  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  30.96 
 
 		 572 aa  248  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  32.85 
 
 		 634 aa  248  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  29.78 
 
 		 618 aa  248  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  30.96 
 
 		 572 aa  248  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.61 
 
 		 572 aa  248  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.57 
 
 		 571 aa  247  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  31.02 
 
 		 590 aa  247  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.13 
 
 		 589 aa  247  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  30.79 
 
 		 610 aa  247  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  32.28 
 
 		 630 aa  247  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30 
 
 		 598 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  32.87 
 
 		 575 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  33.9 
 
 		 1522 aa  247  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  31.63 
 
 		 590 aa  246  6.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  31.04 
 
 		 588 aa  246  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>