More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11050 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 552 aa  1115    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1125  4-phytase  56.19 
 
 		 585 aa  571  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2822  extracellular solute-binding protein  49.82 
 
 		 547 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2540  4-phytase  45.87 
 
 		 561 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000102543 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  48.46 
 
 		 586 aa  465  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13696  periplasmic dipeptide-binding lipoprotein dppA  47.23 
 
 		 541 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.17104 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0565  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  42.75 
 
 		 546 aa  457  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0486  extracellular solute-binding protein  43.56 
 
 		 542 aa  458  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.410451 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0252  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  43.74 
 
 		 546 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.213679  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3915  extracellular solute-binding protein family 5  40.94 
 
 		 543 aa  395  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26170  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  56.4 
 
 		 537 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369222  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  41.02 
 
 		 534 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  39.34 
 
 		 560 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  41.63 
 
 		 533 aa  343  5.999999999999999e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1079  extracellular solute-binding protein family 5  40.91 
 
 		 552 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.133059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0676  4-phytase  41.78 
 
 		 541 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  39.02 
 
 		 554 aa  331  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3630  extracellular solute-binding protein family 5  38.66 
 
 		 522 aa  324  3e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8934  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  34.92 
 
 		 543 aa  299  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3150  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  33.76 
 
 		 537 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.447408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  35.47 
 
 		 543 aa  286  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  36.14 
 
 		 541 aa  276  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  35.78 
 
 		 543 aa  276  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2462  4-phytase  35.55 
 
 		 543 aa  276  9e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.36886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  35.27 
 
 		 543 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4144  extracellular solute-binding protein family 5  34.71 
 
 		 527 aa  256  9e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.482132  hitchhiker  0.00782841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3657  4-phytase  37.13 
 
 		 536 aa  219  7.999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5516  extracellular solute-binding protein family 5  30.72 
 
 		 528 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27 
 
 		 536 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.74 
 
 		 536 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.81 
 
 		 536 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.81 
 
 		 536 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.81 
 
 		 536 aa  158  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  27.37 
 
 		 532 aa  156  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 533 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.03 
 
 		 536 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.62 
 
 		 536 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  27.48 
 
 		 552 aa  148  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 536 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  27.87 
 
 		 545 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  26.23 
 
 		 541 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  28.18 
 
 		 547 aa  136  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.05 
 
 		 543 aa  136  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 		 530 aa  135  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  26.18 
 
 		 554 aa  135  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 561 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 545 aa  133  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 545 aa  133  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 544 aa  133  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  26.43 
 
 		 558 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 533 aa  131  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.05 
 
 		 544 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 		 530 aa  130  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 541 aa  130  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  27.72 
 
 		 543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  27.72 
 
 		 543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  27.72 
 
 		 543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  27.72 
 
 		 543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  28.31 
 
 		 547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 		 590 aa  128  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  27.53 
 
 		 543 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0177  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.68 
 
 		 529 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.584873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 		 556 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 		 526 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 		 544 aa  124  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 549 aa  124  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 		 594 aa  124  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3498  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.08 
 
 		 586 aa  124  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0180  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.78 
 
 		 529 aa  123  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  26.07 
 
 		 556 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 529 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  25.74 
 
 		 555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.16 
 
 		 558 aa  121  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 533 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  27.07 
 
 		 543 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 558 aa  120  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.98 
 
 		 558 aa  120  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 558 aa  120  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.07 
 
 		 543 aa  120  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.07 
 
 		 543 aa  120  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  27.07 
 
 		 543 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 		 535 aa  120  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3850  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 		 522 aa  120  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 		 545 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 540 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 542 aa  119  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.84 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 531 aa  118  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0756  extracellular solute-binding protein family 5  26.47 
 
 		 549 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 		 526 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 		 556 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  30.15 
 
 		 540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  25.18 
 
 		 543 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  27.22 
 
 		 530 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  27.9 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 545 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.19 
 
 		 545 aa  114  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>