More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08130 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  100 
 
 		 503 aa  1006    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  68.93 
 
 		 447 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  67.73 
 
 		 447 aa  593  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  62.72 
 
 		 449 aa  586  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  62.95 
 
 		 455 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  60.72 
 
 		 446 aa  541  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  60.18 
 
 		 450 aa  501  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  59.91 
 
 		 476 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  55.58 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  55.78 
 
 		 443 aa  458  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  58.12 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  56.16 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  56.24 
 
 		 473 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  52.12 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  49.9 
 
 		 480 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  55.36 
 
 		 569 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  48.75 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  51.48 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  42.56 
 
 		 448 aa  364  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  44.8 
 
 		 473 aa  362  9e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  41.23 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  40.09 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  40.51 
 
 		 448 aa  301  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  43.17 
 
 		 481 aa  293  5e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  39.54 
 
 		 461 aa  286  8e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  33.92 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.89 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  35.07 
 
 		 458 aa  264  2e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  34.41 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  34.41 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  34.41 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  34.41 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  33.72 
 
 		 453 aa  261  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  33.95 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  33.95 
 
 		 453 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  33.72 
 
 		 453 aa  259  8e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  33.72 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  33.72 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  33.72 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  32.27 
 
 		 452 aa  247  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.93 
 
 		 494 aa  216  9e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  34.17 
 
 		 474 aa  203  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.55 
 
 		 457 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  42.29 
 
 		 579 aa  201  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0624  amidohydrolase  33.81 
 
 		 394 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  36.11 
 
 		 570 aa  190  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  34.03 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  32.48 
 
 		 431 aa  187  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  33.8 
 
 		 437 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  30.4 
 
 		 468 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  29.77 
 
 		 447 aa  183  6e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  32.69 
 
 		 436 aa  183  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  31.44 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.65 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  32.22 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  32.55 
 
 		 429 aa  179  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.03 
 
 		 434 aa  179  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  31.86 
 
 		 439 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.28 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  31.42 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  32.13 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.59 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.87 
 
 		 447 aa  176  8e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  32.94 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  32.12 
 
 		 442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.77 
 
 		 424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  28.96 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.25 
 
 		 434 aa  174  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.61 
 
 		 429 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  32.96 
 
 		 458 aa  173  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  32.06 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.05 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  30.28 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  33.41 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.05 
 
 		 425 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  30.3 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  30.3 
 
 		 428 aa  171  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  33.26 
 
 		 446 aa  171  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  29.56 
 
 		 441 aa  169  8e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  31.1 
 
 		 443 aa  169  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  31.29 
 
 		 467 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  29.64 
 
 		 426 aa  169  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  29.7 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  32.28 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  32.12 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0124  dihydroorotase  29.89 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00282243  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  28.97 
 
 		 428 aa  167  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  29.8 
 
 		 457 aa  167  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  30.05 
 
 		 428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  29.2 
 
 		 444 aa  166  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  29.2 
 
 		 444 aa  166  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0358  dihydropyrimidinase  32.51 
 
 		 483 aa  166  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.13 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  30.68 
 
 		 446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  32.56 
 
 		 454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  29.2 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  30.47 
 
 		 445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  29.86 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  28.28 
 
 		 448 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.07 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>