More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1392 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1392  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  100 
 
 		 301 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2136  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  70.99 
 
 		 280 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.264144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  61.22 
 
 		 285 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  60.84 
 
 		 285 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  60.38 
 
 		 285 aa  322  6e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0393  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  57.36 
 
 		 284 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5144  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  58.11 
 
 		 285 aa  309  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5004  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  55.85 
 
 		 283 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  55.47 
 
 		 285 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5054  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  55.47 
 
 		 283 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4878  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  55.47 
 
 		 305 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.636657 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  53.64 
 
 		 295 aa  255  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3966  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  49.81 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  48.33 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4596  alpha/beta hydrolase fold protein  46.64 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  40.15 
 
 		 261 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1944  alpha/beta hydrolase fold  36.12 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2786  Alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 271 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  32.18 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.31 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  31.52 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  27.41 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  30.19 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  31.58 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  31.53 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.91 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  25.19 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  25.28 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 261 aa  67  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 267 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 275 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  31.13 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  24.91 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.45 
 
 		 371 aa  65.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  25.28 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  25.28 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  25.28 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  25.28 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  31.01 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  25.19 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  32.68 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  34.89 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  24.5 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  32.68 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  33.91 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  30.43 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  29.11 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  30.68 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.14 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  26.48 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  28 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0636  putative hydrolase, alpha/beta fold family  24 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.208223  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  40.57 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.69 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>