More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4984 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  97.48 
 
 
318 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  98.74 
 
 
318 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  100 
 
 
318 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  99.37 
 
 
354 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  97.8 
 
 
329 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  99.37 
 
 
354 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  98.74 
 
 
318 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  89.03 
 
 
342 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  88.71 
 
 
329 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  83.44 
 
 
330 aa  554  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  84.62 
 
 
317 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  84.62 
 
 
317 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  84.62 
 
 
317 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  84.62 
 
 
317 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  84.29 
 
 
317 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  84.62 
 
 
317 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  82.65 
 
 
317 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  80.82 
 
 
319 aa  534  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  80 
 
 
316 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  80 
 
 
316 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  72.7 
 
 
320 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  72.38 
 
 
320 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  73.02 
 
 
316 aa  481  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  72.38 
 
 
316 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  72.38 
 
 
320 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  75.91 
 
 
306 aa  481  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  70.75 
 
 
319 aa  471  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  71.25 
 
 
319 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  71.56 
 
 
319 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  73.27 
 
 
318 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  72.2 
 
 
315 aa  464  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  71.29 
 
 
320 aa  463  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  68.91 
 
 
322 aa  457  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  70.65 
 
 
315 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  67.21 
 
 
310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  65.41 
 
 
318 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  62.75 
 
 
315 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  49.03 
 
 
322 aa  309  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  47.73 
 
 
318 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  47.91 
 
 
334 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  46.37 
 
 
318 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  45.69 
 
 
324 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  46.86 
 
 
329 aa  292  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  45.98 
 
 
318 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  45.54 
 
 
324 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  48.18 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  48.21 
 
 
317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  47.45 
 
 
324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  46.25 
 
 
354 aa  282  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  45.42 
 
 
327 aa  281  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  48.55 
 
 
334 aa  281  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  45.25 
 
 
315 aa  280  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  45.87 
 
 
315 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  45.87 
 
 
320 aa  279  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  46.38 
 
 
378 aa  279  5e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  45.66 
 
 
321 aa  278  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  43.93 
 
 
315 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  47.56 
 
 
313 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  47.56 
 
 
313 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  44.72 
 
 
369 aa  276  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  47.56 
 
 
313 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  44.69 
 
 
318 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  44.41 
 
 
345 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  44.52 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  45.48 
 
 
325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  47.19 
 
 
315 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  44.26 
 
 
324 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  47.85 
 
 
321 aa  266  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  46.33 
 
 
326 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  46.33 
 
 
326 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  46.33 
 
 
326 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  43.67 
 
 
338 aa  263  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  45.25 
 
 
337 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  45.42 
 
 
316 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  40.84 
 
 
321 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  44.26 
 
 
321 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  43.23 
 
 
319 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  43.23 
 
 
319 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  43.23 
 
 
319 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  46.2 
 
 
317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  43.32 
 
 
316 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  43.97 
 
 
313 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  44.12 
 
 
322 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  45.76 
 
 
310 aa  245  9e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  44.77 
 
 
311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  41.92 
 
 
324 aa  239  4e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  45.64 
 
 
320 aa  235  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  45.92 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  43.19 
 
 
345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  43.19 
 
 
343 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  43.19 
 
 
343 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  41.41 
 
 
305 aa  233  3e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  40.52 
 
 
320 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  45.79 
 
 
321 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  42.02 
 
 
352 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  44.24 
 
 
351 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  40.52 
 
 
320 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  42.86 
 
 
353 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  44.52 
 
 
319 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  44.4 
 
 
356 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>