More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5611 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5248  short chain dehydrogenase  100 
 
 
253 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5611  short chain dehydrogenase  100 
 
 
253 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637794  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4617  short chain dehydrogenase  97.63 
 
 
253 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.891469  hitchhiker  0.00163121 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0080  short chain dehydrogenase  86.61 
 
 
254 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104238  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5440  short chain dehydrogenase  86.51 
 
 
254 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792659  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4890  short chain dehydrogenase  86.9 
 
 
254 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3230  short chain dehydrogenase  81.75 
 
 
254 aa  408  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.272744 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0946  short chain dehydrogenase  72.8 
 
 
253 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1234  short chain dehydrogenase  72.8 
 
 
279 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446635  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1931  short chain dehydrogenase  73.97 
 
 
246 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1673  short chain dehydrogenase  73.97 
 
 
246 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0309  short chain dehydrogenase  73.97 
 
 
246 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2209  short chain dehydrogenase  73.97 
 
 
246 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0219  short chain dehydrogenase  73.55 
 
 
246 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4245  short chain dehydrogenase  66.53 
 
 
249 aa  330  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0225  short chain dehydrogenase  70.4 
 
 
311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3005  short chain dehydrogenase  65.99 
 
 
252 aa  304  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702214  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6980  short chain dehydrogenase  64.78 
 
 
252 aa  299  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3544  short chain dehydrogenase  53.72 
 
 
246 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16365  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
251 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 
256 aa  158  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0899775  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
258 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0532431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1035  short chain dehydrogenase  38.31 
 
 
256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
260 aa  139  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
270 aa  138  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11649  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
260 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3250  short chain dehydrogenase  33.93 
 
 
249 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0558976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3561  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3341  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3306  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3555  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000931047 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3602  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0750697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3256  short chain dehydrogenase  32.44 
 
 
249 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1662  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 
249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.637972  hitchhiker  0.000000702398 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3655  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3565  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0894  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 
246 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.211983  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0959  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2223  short chain dehydrogenase  31.06 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.637126  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1071  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1029  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
246 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2989  short-chain alcohol dehydrogenase/reductase  32.31 
 
 
243 aa  122  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
260 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278227  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 
251 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000130997  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
257 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0120  hypothetical protein  32.19 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  30.6 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
250 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46579  predicted protein  31.17 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00775431  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 
241 aa  79  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362756  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.72 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164626 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  33.6 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  33.17 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.5 
 
 
705 aa  75.9  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09357  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02370)  32.89 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00364064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0994  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  29.25 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
281 aa  75.1  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.013763 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1181  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.78 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0920  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.78 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  32.88 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0452  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.98 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  28.93 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  32.21 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.43 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0445  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.98 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0850  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.77 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.39 
 
 
264 aa  72  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.3 
 
 
243 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
223 aa  72  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
239 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3571  sorbitol dehydrogenase  30.65 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0914  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.331162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4780  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.25 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  29.91 
 
 
516 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.32 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008135 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52827  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.485877  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0066  dehydrogenase/reductase  36.44 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301861 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0420142  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175795  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01740  cytoplasm protein, putative  29.49 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>