More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1145 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
310 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
310 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  45.39 
 
 
298 aa  256  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  43.66 
 
 
302 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  42.76 
 
 
293 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  40.75 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  40.99 
 
 
296 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 
299 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  39.1 
 
 
296 aa  215  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  41.52 
 
 
304 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  40.07 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  40.07 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  40.07 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  40.07 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  40.07 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  40.07 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  38.62 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  40.48 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  40.07 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  40.48 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  40.48 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  39.93 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  42.25 
 
 
296 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  38.52 
 
 
296 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 
336 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 
350 aa  203  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  37.34 
 
 
341 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 
356 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  38.72 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 
347 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  39.46 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 
343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 
343 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  38.11 
 
 
348 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 
348 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  37.85 
 
 
305 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 
346 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  33.8 
 
 
337 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  35.99 
 
 
364 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  36.66 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 
354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 
349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  38.54 
 
 
307 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  36.16 
 
 
350 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  36.39 
 
 
340 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  37.89 
 
 
308 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  38.19 
 
 
347 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  36.33 
 
 
352 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  35.69 
 
 
347 aa  186  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
354 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  36.59 
 
 
347 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  37.29 
 
 
345 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 
347 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
350 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 
308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
347 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  34.32 
 
 
349 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  34.64 
 
 
341 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 
347 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  34.98 
 
 
347 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 
346 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 
346 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  35.56 
 
 
350 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 
293 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 
341 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  36.4 
 
 
456 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  36.4 
 
 
444 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  36.4 
 
 
453 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 
305 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
287 aa  90.9  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
287 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  26.22 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  25.49 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  24.28 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  24.28 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  24.28 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  24.28 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  24.28 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  24.28 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  24.28 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  23.63 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  23.72 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38202  epoxide hydrolase, soluble (sEH)  23.57 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.927116  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  25.69 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>