45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0746 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  100 
 
 		 389 aa  763    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  34.32 
 
 		 404 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  37.1 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  37.11 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  31.94 
 
 		 397 aa  96.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  28.85 
 
 		 442 aa  89.4  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  27.82 
 
 		 502 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  27.47 
 
 		 502 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  30.74 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  30 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  30.84 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1238  membrane protein  30.66 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375166  normal  0.0948074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  30.9 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  26.17 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  30.47 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  27.44 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  30.47 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  29.62 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  29.12 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  28.02 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  31.33 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  25.88 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  26.69 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  31.55 
 
 		 336 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  36.73 
 
 		 468 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  35.71 
 
 		 339 aa  53.5  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  27.61 
 
 		 347 aa  53.1  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  30.96 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  28.71 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  26.69 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  31.86 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  31.65 
 
 		 408 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  29.81 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  34.69 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  24.29 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  29.34 
 
 		 229 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0220  hypothetical protein  25 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0226  hypothetical protein  25 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  29.21 
 
 		 492 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  25.88 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  29.55 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  35.79 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  26.45 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  26.14 
 
 		 228 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  25.42 
 
 		 313 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>