More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5583 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  100 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  96.88 
 
 		 224 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  96.88 
 
 		 224 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  98.21 
 
 		 224 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  96.43 
 
 		 224 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  95.54 
 
 		 224 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  86.61 
 
 		 224 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  84.82 
 
 		 224 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  84.38 
 
 		 224 aa  380  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  83.04 
 
 		 224 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4275  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  79.82 
 
 		 224 aa  362  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2484  HAD family hydrolase  73.3 
 
 		 233 aa  335  3.9999999999999995e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  73.99 
 
 		 224 aa  334  7e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  74.89 
 
 		 224 aa  332  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  73.18 
 
 		 225 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2149  HAD family hydrolase  78.92 
 
 		 224 aa  321  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2426  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  79.37 
 
 		 224 aa  321  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2109  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  78.92 
 
 		 224 aa  321  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  71.36 
 
 		 232 aa  313  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0131  HAD family hydrolase  65.62 
 
 		 224 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0276  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  65.62 
 
 		 327 aa  295  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  60.55 
 
 		 228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  40.09 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  40.27 
 
 		 234 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  42.53 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  38.32 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  38.32 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  38.32 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0228  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.16 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424895  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3439  HAD family hydrolase  35.98 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1750  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.07 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428028  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.73 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.72 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  37.62 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  35.1 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  35.81 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1880  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 230 aa  114  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615565  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.6 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.63 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4680  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.57 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.42 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.23 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3915  HAD family hydrolase  29.3 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  29.86 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.13 
 
 		 260 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  32.74 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.97 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  29.35 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  31.05 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  31.55 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  35.71 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  35.71 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  35.71 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  35.71 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  35.71 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  34.78 
 
 		 762 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.99 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.89 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  31.19 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  29.11 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  31.96 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0442  HAD family hydrolase  32.02 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  36.32 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  34.24 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  36.32 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1427  HAD family hydrolase  33.16 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.828576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.27 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  29.17 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  36.32 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.32 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  36.32 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  36.32 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  36.32 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  36.32 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  35.33 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  35.33 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  35.33 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  35.33 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.34 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  35.33 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  29.73 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.23 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  34.22 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  31.96 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  34.62 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  28.41 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.65 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  34.52 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  35.79 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  33.72 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  28.77 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0689  HAD family hydrolase  33.17 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.319596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>