More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0608 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  97.18 
 
 		 425 aa  808    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  95.29 
 
 		 425 aa  792    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  84.54 
 
 		 499 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  99.29 
 
 		 425 aa  818    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  95.53 
 
 		 425 aa  776    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  79.29 
 
 		 425 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  86.44 
 
 		 427 aa  704    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  79.76 
 
 		 425 aa  668    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  97.18 
 
 		 425 aa  808    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  97.18 
 
 		 425 aa  808    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  77.83 
 
 		 425 aa  659    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  100 
 
 		 425 aa  824    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  57.28 
 
 		 427 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  55.84 
 
 		 428 aa  474  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  54.61 
 
 		 440 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  55.37 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  55.37 
 
 		 428 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  54.91 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  56.7 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  56.07 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  56.06 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  54.33 
 
 		 438 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  52.63 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  52.79 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  52.12 
 
 		 452 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  52.12 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  52.12 
 
 		 435 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  52.42 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1004  major facilitator family transporter  51.37 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0563  putative integral membrane transport protein  51.37 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  50.94 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.78 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  51.95 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  51.8 
 
 		 444 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  50.95 
 
 		 431 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  51.69 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  51.06 
 
 		 424 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  51.4 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  49.76 
 
 		 447 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  50.38 
 
 		 438 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  50.63 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  50.61 
 
 		 435 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  50.63 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  50.38 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  46.34 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  46.57 
 
 		 436 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  49 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  48.24 
 
 		 430 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  48.24 
 
 		 430 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  49.51 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  48.33 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  48.33 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  47.66 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  48.24 
 
 		 430 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  48.24 
 
 		 430 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  47.26 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  45.65 
 
 		 438 aa  372  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  48.48 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  47.26 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  46.08 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  47.51 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  46.08 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  47.26 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  47.76 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  48.76 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 438 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  44.31 
 
 		 436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  44.94 
 
 		 439 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  48.01 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  45.43 
 
 		 439 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  43.66 
 
 		 436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  43.84 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.81 
 
 		 452 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 447 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 		 452 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  46 
 
 		 428 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 440 aa  328  9e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  43.81 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  44.88 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  44.04 
 
 		 437 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  44.04 
 
 		 437 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  45.32 
 
 		 440 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  45.17 
 
 		 443 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  45.17 
 
 		 443 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  45.17 
 
 		 443 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 443 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  45.81 
 
 		 443 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  44.16 
 
 		 431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  45.32 
 
 		 443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  44.04 
 
 		 437 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  45.32 
 
 		 445 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  45.32 
 
 		 445 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3060  transporter transmembrane protein  43.54 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1366  major facilitator transporter  41.72 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  45.32 
 
 		 445 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  45.32 
 
 		 420 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>