243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5566 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 325 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  71.91 
 
 		 334 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  61.4 
 
 		 294 aa  348  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  47.37 
 
 		 329 aa  309  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  46.65 
 
 		 330 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  46.65 
 
 		 330 aa  298  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  45.82 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  45.51 
 
 		 331 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  46.34 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  46.34 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  46.34 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  46.75 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  47.53 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  46.32 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  46.32 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  46.32 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  46.32 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  46.32 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  46.32 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  46.32 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  46.2 
 
 		 331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  46.82 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  42.07 
 
 		 325 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  42.07 
 
 		 325 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  38.98 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  38.29 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  36.22 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  34.6 
 
 		 319 aa  185  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  38.74 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  36.39 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  33.54 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  34.19 
 
 		 346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  31.75 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  33.55 
 
 		 348 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  33.55 
 
 		 362 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  33.55 
 
 		 362 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  33.55 
 
 		 381 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  33.55 
 
 		 381 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  33.55 
 
 		 362 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  32.06 
 
 		 362 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  31.43 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  31.05 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  31.11 
 
 		 348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  31.11 
 
 		 348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  31.11 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  31.95 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  31.33 
 
 		 321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  31.82 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  32.06 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  30.32 
 
 		 338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  32.99 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  31.91 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  32.84 
 
 		 268 aa  122  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  28.95 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.87 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  32.11 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  27.23 
 
 		 227 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  26.98 
 
 		 208 aa  62  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  31.74 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  24.87 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  27.33 
 
 		 209 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.42 
 
 		 209 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0726  SNARE associated Golgi protein  25.69 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  27.59 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  28.11 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  30.12 
 
 		 217 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  30.2 
 
 		 224 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 676 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  32 
 
 		 245 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1391  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.74 
 
 		 201 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  27.54 
 
 		 221 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.89 
 
 		 215 aa  52.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  23.95 
 
 		 204 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  25.66 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.56 
 
 		 207 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  27.88 
 
 		 215 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  32 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  25.59 
 
 		 204 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  26.07 
 
 		 204 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  26.07 
 
 		 204 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  26.07 
 
 		 204 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  26.07 
 
 		 204 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  36.08 
 
 		 141 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 		 141 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  27.22 
 
 		 224 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  28.48 
 
 		 218 aa  50.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  25.71 
 
 		 199 aa  50.1  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  24.7 
 
 		 208 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  30.23 
 
 		 199 aa  50.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  25.59 
 
 		 204 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  23.81 
 
 		 201 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  25.58 
 
 		 677 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  29.73 
 
 		 220 aa  49.7  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  25.59 
 
 		 204 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  24.17 
 
 		 204 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  21.83 
 
 		 203 aa  49.7  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  27.84 
 
 		 202 aa  49.7  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>