48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1448 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 280 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  87.14 
 
 		 280 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  68.12 
 
 		 295 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  62.99 
 
 		 275 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  62.99 
 
 		 275 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  62.99 
 
 		 275 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  64.15 
 
 		 275 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  73.58 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  64.37 
 
 		 284 aa  285  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  74.27 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  74.27 
 
 		 311 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  74.27 
 
 		 311 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  74.27 
 
 		 311 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  74.27 
 
 		 311 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  74.27 
 
 		 311 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  74.27 
 
 		 311 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  65.13 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  45.06 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.78 
 
 		 307 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.78 
 
 		 307 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  43.04 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  42.78 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  42.15 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.23 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  42.94 
 
 		 343 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  35 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 237 aa  96.3  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  37.87 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  33.77 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  31.76 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  30.09 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 409 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  28.21 
 
 		 229 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  32.77 
 
 		 398 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  29.41 
 
 		 821 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  29.41 
 
 		 776 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  29.41 
 
 		 776 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  29.41 
 
 		 776 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  28.21 
 
 		 231 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  23 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2013  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1402 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  31.93 
 
 		 581 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.63 
 
 		 707 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04192  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05900)  32.94 
 
 		 634 aa  42.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.107548  normal  0.45593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>