194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0448 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0448  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  100 
 
 
456 aa  919    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1030  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  75.25 
 
 
617 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2765  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  75.5 
 
 
554 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2622  polysaccharide deacetylase family protein  86.74 
 
 
279 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.424992  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0150  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  86.38 
 
 
279 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  53.91 
 
 
395 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  53.91 
 
 
437 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  53.91 
 
 
274 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  53.91 
 
 
274 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  53.62 
 
 
310 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3226  polysaccharide deacetylase family protein  53.62 
 
 
437 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107526  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  53.62 
 
 
378 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  53.62 
 
 
296 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  49.35 
 
 
357 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  47.18 
 
 
263 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  47.18 
 
 
263 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  42.11 
 
 
264 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  40.57 
 
 
296 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  39.11 
 
 
278 aa  179  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  37.35 
 
 
258 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  39.11 
 
 
256 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  35.98 
 
 
262 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  38.02 
 
 
264 aa  176  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  35.02 
 
 
274 aa  176  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  33.2 
 
 
273 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 
295 aa  167  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  29.96 
 
 
391 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  28.06 
 
 
306 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  28.06 
 
 
306 aa  94.4  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 
321 aa  89.7  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 
373 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 
349 aa  86.3  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.42 
 
 
319 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
348 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  26.54 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  23.5 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 
370 aa  79  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
316 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  27.55 
 
 
510 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  25.68 
 
 
357 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 
348 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 
348 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 
354 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
266 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  26.54 
 
 
488 aa  75.1  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  26.73 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  26.76 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  27.7 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  23.58 
 
 
305 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 
319 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2279  polysaccharide deacetylase  27.37 
 
 
318 aa  72  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  26.94 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  27.12 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 
276 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  27.17 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  25.32 
 
 
284 aa  68.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  31.18 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  24.3 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.24 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  29.58 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  27.51 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  18.1 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  18.1 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  20.71 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  21.7 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  23.93 
 
 
628 aa  66.6  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  23.35 
 
 
234 aa  65.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 
344 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 
426 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 
282 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.83 
 
 
409 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
342 aa  64.3  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 
251 aa  63.5  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 
645 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  25.47 
 
 
640 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  24.49 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  24.49 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  24.49 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
289 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  24.49 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.83 
 
 
409 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
255 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 
297 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  20.28 
 
 
289 aa  61.6  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  24.49 
 
 
409 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  25.65 
 
 
353 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
264 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  22.27 
 
 
271 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 
259 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>