140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_2202 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  BT9727_2202  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 
102 aa  207  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2348  PadR family transcriptional regulator  68.32 
 
 
101 aa  146  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2060  PadR family transcriptional regulator  68.32 
 
 
101 aa  146  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1141  transcriptional regulator, PadR family  63.73 
 
 
102 aa  137  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.386385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0613  PadR-like family transcriptional regulator  60 
 
 
101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0216  PadR-like family transcriptional regulator  55.06 
 
 
92 aa  106  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1435  PadR family transcriptional regulator  51.58 
 
 
128 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.666797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4437  transcriptional regulator, PadR-like family  51.58 
 
 
97 aa  103  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.873187 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0730  PadR family transcriptional regulator  53.19 
 
 
99 aa  100  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.118827  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_710  transcriptional regulator, PadR-type  51.06 
 
 
99 aa  100  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0242268  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  47.37 
 
 
107 aa  100  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2227  PadR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42968  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2687  PadR family transcriptional regulator  52 
 
 
119 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3107  transcriptional regulator, PadR-like family  47.83 
 
 
103 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4772  PadR-like family transcriptional regulator  43.96 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4665  PadR-like family transcriptional regulator  43.96 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1225  PadR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
100 aa  87  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2857  transcriptional regulator, PadR-like family  44.68 
 
 
100 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5527  PadR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
108 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  34.83 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
115 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  36.56 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  36.14 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  40.66 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  31.4 
 
 
117 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  27.27 
 
 
111 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5749  putative PadR-like family transcriptional regulator  27.55 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
121 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  33.71 
 
 
117 aa  50.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  34.88 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
119 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  32.58 
 
 
115 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  29 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  34.94 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  34.94 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  34.94 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  34.34 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  53.66 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  42.11 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  34.18 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  33.73 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  34.38 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  34.38 
 
 
128 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  34.38 
 
 
128 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  36.71 
 
 
110 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  34.38 
 
 
128 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  32.81 
 
 
118 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  33.68 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  33.72 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  32.14 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04310  transcriptional regulator, PadR family  32.5 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  33 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  35.23 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  36.59 
 
 
371 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2473  hypothetical protein  27.1 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.140746  normal  0.551576 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  40.28 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0067  PadR-like family transcriptional regulator  38.36 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.995572  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1173  PadR-like family transcriptional regulator  31.71 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  32.53 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  32.61 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  31.58 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1270  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  27.55 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  35.59 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2817  hypothetical protein  25.51 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  32.61 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2621  hypothetical protein  26.17 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.065619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2812  hypothetical protein  26.17 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0612725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0276  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00724542  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  33.7 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2819  hypothetical protein  26.17 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000193161 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0690  PadR-like family transcriptional regulator  34.43 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  30.23 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  39.29 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  34.09 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2570  PadR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
115 aa  42.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0894  transcriptional regulator PadR-like protein  34.62 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  32.93 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  32.05 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>