More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1417 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
285 aa  569  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  92.63 
 
 
298 aa  535  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  61.59 
 
 
290 aa  349  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.78676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.44 
 
 
292 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.09 
 
 
292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.56 
 
 
291 aa  318  7.999999999999999e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2857  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.17 
 
 
290 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.94 
 
 
297 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  55.92 
 
 
310 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  44.56 
 
 
321 aa  235  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  42.36 
 
 
298 aa  228  8e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  45.23 
 
 
296 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  43.97 
 
 
296 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3377  ribosomal L11 methyltransferase  44.17 
 
 
295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288967  decreased coverage  0.00145631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2012  ribosomal L11 methyltransferase  43.82 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.11 
 
 
298 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  47.06 
 
 
290 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0776  ribosomal L11 methyltransferase  40.69 
 
 
300 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374062  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2210  ribosomal L11 methyltransferase  43.97 
 
 
291 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928859  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0558  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.97 
 
 
291 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  41.86 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2089  ribosomal L11 methyltransferase  50.49 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1227  ribosomal L11 methyltransferase  42.8 
 
 
291 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  46.5 
 
 
289 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4993  ribosomal L11 methyltransferase  39.08 
 
 
305 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135783  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0554  ribosomal L11 methyltransferase  42.91 
 
 
323 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4479  ribosomal L11 methyltransferase  38.81 
 
 
305 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2376  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.14 
 
 
289 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06603  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2334  ribosomal L11 methyltransferase  40.35 
 
 
306 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.783538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4944  ribosomal L11 methyltransferase  38.46 
 
 
305 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.478731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1100  ribosomal L11 methyltransferase  41.57 
 
 
289 aa  185  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.441785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1315  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.8 
 
 
325 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213416  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0744  ribosomal L11 methyltransferase  43.03 
 
 
310 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1424  ribosomal L11 methyltransferase  42.2 
 
 
308 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  42.06 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2060  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  50 
 
 
286 aa  165  9e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1746  ribosomal L11 methyltransferase  41.97 
 
 
309 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1742  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.97 
 
 
318 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.61 
 
 
297 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0212  ribosomal L11 methyltransferase  43.16 
 
 
301 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0793007 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  45.36 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.36 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.36 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.71 
 
 
286 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.44 
 
 
299 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.54 
 
 
506 aa  135  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.65 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.32 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.24 
 
 
299 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.79 
 
 
327 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.32 
 
 
328 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1348  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.67 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.38 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.62 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.79 
 
 
296 aa  125  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.55 
 
 
306 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.38 
 
 
300 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.74 
 
 
297 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.95 
 
 
306 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.81 
 
 
298 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.92 
 
 
298 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.94 
 
 
315 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.17 
 
 
295 aa  122  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1047  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.15 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.85 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.02 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.73 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.16 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.79 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.6 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.73 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2055  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.09 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.62 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.45 
 
 
300 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0920  ribosomal L11 methyltransferase  38.46 
 
 
283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.85 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.39 
 
 
304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.11 
 
 
296 aa  119  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.85 
 
 
315 aa  118  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.98 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.98 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2156  ribosomal L11 methyltransferase  37.3 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.35 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.98 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.98 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.1 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.38 
 
 
300 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  39.27 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.85 
 
 
304 aa  116  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.83 
 
 
295 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.72 
 
 
316 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  39.9 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.45 
 
 
293 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.2 
 
 
295 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.56 
 
 
305 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.98 
 
 
300 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.97 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.35 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.47 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>