More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0879 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 337 aa  684    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  99.12 
 
 		 339 aa  677    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  90.27 
 
 		 339 aa  627  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  61.06 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  57.61 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.21 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.72 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  55.82 
 
 		 338 aa  349  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.93 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.73 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  52.11 
 
 		 342 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.81 
 
 		 341 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.7 
 
 		 339 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.52 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.85 
 
 		 342 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.64 
 
 		 343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.34 
 
 		 343 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.45 
 
 		 341 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.76 
 
 		 351 aa  309  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  52.49 
 
 		 338 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.65 
 
 		 338 aa  308  8e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.85 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.25 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.61 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.36 
 
 		 341 aa  298  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.15 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.51 
 
 		 335 aa  275  8e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  43.64 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.96 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.21 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.21 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.66 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.57 
 
 		 353 aa  240  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.72 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.17 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.48 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  48.4 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.69 
 
 		 337 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.94 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.1 
 
 		 364 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.3 
 
 		 340 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.34 
 
 		 365 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.34 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  40.75 
 
 		 365 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  39.23 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  38.71 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1468  beta-hexosaminidase  38.19 
 
 		 335 aa  159  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0176842  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.68 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.65 
 
 		 346 aa  156  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  36.56 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1525  beta-hexosaminidase  37.3 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.276065  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  32.76 
 
 		 363 aa  152  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  37.79 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  35.69 
 
 		 517 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.46 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  32.89 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  37.23 
 
 		 347 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 		 357 aa  149  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.84 
 
 		 362 aa  149  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  35.97 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 		 353 aa  149  8e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  34.74 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  36.46 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.98 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  34.17 
 
 		 360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  33.81 
 
 		 360 aa  145  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  35 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.33 
 
 		 478 aa  145  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  33.92 
 
 		 490 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  34.39 
 
 		 381 aa  145  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  35.61 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  36.17 
 
 		 327 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.81 
 
 		 528 aa  143  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.38 
 
 		 511 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  34.89 
 
 		 336 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2614  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 		 369 aa  142  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  33.98 
 
 		 511 aa  142  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3261  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 		 369 aa  142  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0432032 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  33.11 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  33.11 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  33.11 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  33.11 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  33.11 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  32.66 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  33.11 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  33.11 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  30.42 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  32.73 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01728  beta-hexosaminidase  38.85 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  33.69 
 
 		 349 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.87 
 
 		 398 aa  139  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  33.21 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  35.61 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.64 
 
 		 347 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  31.99 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  34.17 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  33.09 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2067  glycoside hydrolase family protein  37.94 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.268597  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2825  beta-hexosaminidase  37.19 
 
 		 354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0655  glycosy hydrolase family protein  32.98 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448002  normal  0.264846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>