67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1670 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1670  hypothetical protein  100 
 
 
1207 aa  2461    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0229  hypothetical protein  60.92 
 
 
1252 aa  1476    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  32.93 
 
 
1506 aa  545  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  31.81 
 
 
1413 aa  535  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1974  hypothetical protein  30.79 
 
 
1499 aa  499  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  32.73 
 
 
1392 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0899  DNA helicase  29.24 
 
 
1412 aa  413  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403081  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  26.54 
 
 
1400 aa  328  5e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24380  hypothetical protein  27.75 
 
 
1670 aa  313  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.694198  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  25.67 
 
 
1407 aa  312  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16460  hypothetical protein  27.28 
 
 
1254 aa  269  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3697  hypothetical protein  24.81 
 
 
1274 aa  150  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141497  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  22.99 
 
 
1559 aa  105  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23940  hypothetical protein  23.47 
 
 
1217 aa  96.7  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  21.75 
 
 
1622 aa  96.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  22.98 
 
 
1877 aa  92.8  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  21.99 
 
 
1754 aa  92.4  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  22.08 
 
 
1854 aa  92.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  23.29 
 
 
1575 aa  89  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  21.93 
 
 
1861 aa  87  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  21.89 
 
 
1958 aa  86.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  25.61 
 
 
2045 aa  85.9  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  30.24 
 
 
1593 aa  84.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  23.62 
 
 
1589 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  23.62 
 
 
1589 aa  81.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.2 
 
 
1403 aa  80.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  22.36 
 
 
2198 aa  78.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  22.48 
 
 
2013 aa  78.6  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  24.34 
 
 
2207 aa  78.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  22.34 
 
 
2222 aa  77.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  24.13 
 
 
1803 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  26.87 
 
 
1867 aa  75.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  29.35 
 
 
1589 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  30.39 
 
 
1571 aa  75.5  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  23.29 
 
 
2016 aa  75.1  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  22.26 
 
 
1983 aa  73.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  21.48 
 
 
2002 aa  72  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  21.04 
 
 
1986 aa  71.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  24.5 
 
 
1822 aa  71.6  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  28.29 
 
 
1853 aa  70.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  27.57 
 
 
1801 aa  70.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  26.98 
 
 
1559 aa  69.7  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  25.08 
 
 
1991 aa  69.3  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  27.32 
 
 
1722 aa  69.3  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  19.18 
 
 
1959 aa  68.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  25.11 
 
 
1973 aa  68.6  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  23.54 
 
 
1980 aa  63.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  27.31 
 
 
2197 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  25.45 
 
 
1572 aa  62.8  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  20.85 
 
 
2096 aa  61.6  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  22.49 
 
 
1904 aa  60.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  20.26 
 
 
1328 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  23.96 
 
 
1888 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  26.32 
 
 
2204 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  20.7 
 
 
1950 aa  59.3  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  22.88 
 
 
2759 aa  58.9  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  22.33 
 
 
1945 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  20.07 
 
 
1958 aa  57  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  25.1 
 
 
1823 aa  53.5  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.96 
 
 
1363 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  27.55 
 
 
1838 aa  52.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  27.4 
 
 
2125 aa  50.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  19.17 
 
 
1296 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  27.4 
 
 
2125 aa  50.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  26.05 
 
 
2123 aa  47.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  27.72 
 
 
1328 aa  46.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  22.94 
 
 
1285 aa  45.8  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>