More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1489 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1489  LacI family response repressor  100 
 
 		 256 aa  524  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1322  LacI family response repressor  36.44 
 
 		 344 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.465092  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2799  transcriptional regulator, LacI family  38.13 
 
 		 340 aa  150  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1292  transcriptional regulator, LacI family  35.02 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1488  LacI family response repressor  33.46 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1318  LacI family response repressor  36.33 
 
 		 336 aa  141  9e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.119217  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1506  LacI family response repressor  29.76 
 
 		 338 aa  139  6e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1304  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  31.87 
 
 		 337 aa  136  4e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  34.35 
 
 		 363 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2545  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.04 
 
 		 341 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3955  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 		 364 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337972  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4014  Alanine racemase  31.35 
 
 		 330 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.251479 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22460  transcriptional regulator  36.29 
 
 		 339 aa  112  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.912929  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 348 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  33.08 
 
 		 351 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  31.3 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  33.17 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0417  LacI family transcription regulator  28.63 
 
 		 354 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  28.5 
 
 		 336 aa  99.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  33.19 
 
 		 336 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.8 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3985  transcriptional regulator, LacI family  32.8 
 
 		 338 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.610149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4446  transcriptional regulator, LacI family  33.5 
 
 		 348 aa  95.9  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1332  transcriptional regulator, LacI family  28.79 
 
 		 377 aa  95.1  9e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1620  LacI family transcription regulator  32.16 
 
 		 337 aa  94.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  31.07 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0742  LacI family transcription regulator  32.32 
 
 		 342 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.13843  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3970  LacI family transcription regulator  29.39 
 
 		 348 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  32.02 
 
 		 333 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.99 
 
 		 353 aa  92.4  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3319  transcriptional regulator, LacI family  30.67 
 
 		 337 aa  92.4  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419074  normal  0.0675752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  27.24 
 
 		 352 aa  92  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  34.59 
 
 		 348 aa  92  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  29.67 
 
 		 340 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  30.67 
 
 		 351 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  29.88 
 
 		 332 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5149  transcriptional regulator, LacI family  29.92 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  27.95 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 342 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0081  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 533 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0322745  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  34.78 
 
 		 334 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.7 
 
 		 335 aa  89.7  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0627  transcriptional regulator, LacI family  28.85 
 
 		 350 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.958953 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1397  LacI family transcription regulator  32.69 
 
 		 340 aa  89.7  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620296 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  35.88 
 
 		 338 aa  89  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  31.31 
 
 		 384 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  31.31 
 
 		 352 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 		 336 aa  88.6  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  26.91 
 
 		 336 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  29.18 
 
 		 330 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  28.29 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3482  Alanine racemase  29.96 
 
 		 359 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  24.49 
 
 		 332 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5117  transcriptional regulator, LacI family  29.3 
 
 		 320 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  26.07 
 
 		 344 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  29.53 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 335 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.14 
 
 		 337 aa  86.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3033  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 		 351 aa  87  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0549  Alanine racemase  31.72 
 
 		 340 aa  87  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1479  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 362 aa  86.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 342 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  30.89 
 
 		 342 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0764  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.79 
 
 		 348 aa  85.9  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  26.91 
 
 		 338 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  28.02 
 
 		 337 aa  85.9  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1849  LacI family transcription regulator  28.32 
 
 		 358 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0321954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3001  transcriptional regulator, LacI family  29.38 
 
 		 343 aa  85.9  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25 
 
 		 335 aa  85.9  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  27.53 
 
 		 336 aa  85.5  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  28.24 
 
 		 351 aa  85.5  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.59 
 
 		 335 aa  85.5  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2559  alanine racemase  27.43 
 
 		 358 aa  85.9  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0819  transcriptional regulator, LacI family  30.29 
 
 		 348 aa  85.1  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0971  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.89 
 
 		 350 aa  85.1  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  30.8 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2164  LacI family transcription regulator  29.59 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  25.79 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  24.51 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  29.17 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1312  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  29.74 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  24.08 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3162  transcriptional regulator, LacI family  32.2 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  24.08 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  24.08 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  32.61 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0091  LacI family transcription regulator  29.15 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  26.18 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1754  transcriptional regulator, LacI family  30.5 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000321603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  24.49 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01740  transcriptional regulator  28.29 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  30.38 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2175  transcriptional regulator, LacI family  27.55 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.408939  normal  0.717598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0271  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  24.08 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0036  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.84 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.020454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0141  transcriptional regulator, LacI family  38.29 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  29.27 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>