113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_5538 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_5538  DNA-binding transcriptional activator YeiL  100 
 
 		 223 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5089  DNA-binding transcriptional activator YeiL  95.52 
 
 		 223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5261  DNA-binding transcriptional activator YeiL  95.52 
 
 		 223 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00514717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5106  DNA-binding transcriptional activator YeiL  95.52 
 
 		 223 aa  443  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.888495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5659  DNA-binding transcriptional activator YeiL  95.52 
 
 		 223 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5504  DNA-binding transcriptional activator YeiL  95.07 
 
 		 223 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5589  DNA-binding transcriptional activator YeiL  94.17 
 
 		 223 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5203  DNA-binding transcriptional activator YeiL  87 
 
 		 223 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5533  DNA-binding transcriptional activator YeiL  83.41 
 
 		 223 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5419  DNA-binding transcriptional activator YeiL  83.41 
 
 		 223 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.74 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2310  DNA-binding transcriptional activator YeiL  44.34 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  decreased coverage  0.000186485 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1495  cyclic nucleotide-binding protein  43.44 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  43.44 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288775  normal  0.0803895 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2460  DNA-binding transcriptional activator YeiL  45.32 
 
 		 219 aa  175  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.572747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02092  DNA-binding transcriptional activator of stationary phase nitrogen survival  45.32 
 
 		 219 aa  174  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1485  DNA-binding transcriptional activator YeiL  45.32 
 
 		 219 aa  174  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0399687  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02051  hypothetical protein  45.32 
 
 		 219 aa  174  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  44.83 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3454  cyclic nucleotide-binding domain protein  34.65 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.636337  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3470  cyclic nucleotide-binding domain protein  33.77 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3165  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3162  cyclic nucleotide-binding protein  33.77 
 
 		 230 aa  134  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3228  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000617944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1794  cyclic nucleotide-binding domain protein  33.33 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3461  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3255  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00717521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3510  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3481  cyclic nucleotide-binding domain protein  33.33 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0295032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0336  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.08 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0158598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1761  cyclic nucleotide-binding protein  34.39 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1894  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.23 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000758315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2419  catabolite gene activator  26.58 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2368  catabolite gene activator  27.48 
 
 		 231 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2964  catabolite gene activator  27.4 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117686  normal  0.0504815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2212  cyclic nucleotide-binding protein  25.68 
 
 		 230 aa  88.2  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1300  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0206  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000707778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.89 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3786  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0919672  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0522  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192194  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_002950  PG0396  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.81 
 
 		 348 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1723  cyclic nucleotide-binding  30.86 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.86 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.14 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.42 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4433  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.86 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  19.9 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.42 
 
 		 352 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1785  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.67 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  31.19 
 
 		 624 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.32 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3749  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.9168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0548  cAMP-regulatory protein  32.81 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0436  transcription regulator  23.33 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0316636  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  20 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.65 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4909  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.61 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.43 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0267635  normal  0.395563 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  18.93 
 
 		 355 aa  43.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.54 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  18.85 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  18.32 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.41 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.35 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4272  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.53 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71016  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  18.32 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  19.27 
 
 		 210 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.27 
 
 		 210 aa  42  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  19.27 
 
 		 210 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>