104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_3470 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006274  BCZK3165  transcriptional regulator  99.57 
 
 
230 aa  471  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3470  cyclic nucleotide-binding domain protein  100 
 
 
230 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3228  transcriptional regulator  97.39 
 
 
230 aa  460  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000617944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3255  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  96.96 
 
 
230 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00717521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3510  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  96.96 
 
 
230 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3481  cyclic nucleotide-binding domain protein  96.09 
 
 
243 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0295032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3461  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  94.78 
 
 
230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3162  cyclic nucleotide-binding protein  95.65 
 
 
230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3454  cyclic nucleotide-binding domain protein  95.65 
 
 
230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.636337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1794  cyclic nucleotide-binding domain protein  94.78 
 
 
230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0336  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.11 
 
 
223 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0158598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5089  DNA-binding transcriptional activator YeiL  34.21 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5261  DNA-binding transcriptional activator YeiL  34.21 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00514717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5106  DNA-binding transcriptional activator YeiL  34.21 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.888495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5659  DNA-binding transcriptional activator YeiL  34.21 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5589  DNA-binding transcriptional activator YeiL  33.77 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5504  DNA-binding transcriptional activator YeiL  34.21 
 
 
223 aa  138  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2368  catabolite gene activator  32.29 
 
 
231 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2964  catabolite gene activator  32.29 
 
 
231 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117686  normal  0.0504815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5538  DNA-binding transcriptional activator YeiL  33.77 
 
 
223 aa  135  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5203  DNA-binding transcriptional activator YeiL  33.33 
 
 
223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5419  DNA-binding transcriptional activator YeiL  33.77 
 
 
223 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5533  DNA-binding transcriptional activator YeiL  32.46 
 
 
223 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2419  catabolite gene activator  31.22 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2212  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2310  DNA-binding transcriptional activator YeiL  31.14 
 
 
232 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  decreased coverage  0.000186485 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.8 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1495  cyclic nucleotide-binding protein  30.26 
 
 
232 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  30.26 
 
 
232 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288775  normal  0.0803895 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2460  DNA-binding transcriptional activator YeiL  30.7 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.572747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02092  DNA-binding transcriptional activator of stationary phase nitrogen survival  30.23 
 
 
219 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1485  DNA-binding transcriptional activator YeiL  30.23 
 
 
219 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0399687  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02051  hypothetical protein  30.23 
 
 
219 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  30.23 
 
 
219 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266371  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1300  cyclic nucleotide-binding protein  33.85 
 
 
224 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0522  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.96 
 
 
224 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3786  transcriptional regulator  28.89 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0919672  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0206  transcriptional regulator  31.41 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000707778  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1894  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.64 
 
 
214 aa  91.3  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000758315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.56 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1761  cyclic nucleotide-binding protein  26.7 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  23.83 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.47 
 
 
348 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.04 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.31 
 
 
228 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.83 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.83 
 
 
230 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.53 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  23.47 
 
 
355 aa  52.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.71 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3301  cyclic nucleotide-binding protein  23.44 
 
 
229 aa  52.4  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00259627 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.28 
 
 
244 aa  52  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.28 
 
 
244 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.16 
 
 
225 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.16 
 
 
226 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0512  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.52 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.12 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.41 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.88 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  18.14 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  24.23 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.87 
 
 
244 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.53 
 
 
229 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.65 
 
 
225 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.94 
 
 
352 aa  48.5  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.6 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.54 
 
 
225 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.55 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.8 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.04 
 
 
225 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.1 
 
 
218 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.16 
 
 
223 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.09 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5005  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.99 
 
 
261 aa  45.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62031  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.08 
 
 
227 aa  45.1  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.51 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  17.73 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.65 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0605  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.42 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0780  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.12 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.390237  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0388  cyclic nucleotide-binding protein  21.28 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0473  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.67 
 
 
272 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06137  hypothetical protein  23.18 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.5 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.42 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0464  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.67 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0498511  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0401  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.96 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0458  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.96 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0061  cyclic nucleotide-binding protein  21.57 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3386  cyclic nucleotide-binding protein  21.57 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.79 
 
 
354 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.08 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  21.43 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1859  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.91 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  17.91 
 
 
255 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1160  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.58 
 
 
242 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.47 
 
 
233 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.26 
 
 
224 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>