180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0061 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0061  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
237 aa  485  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3386  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
237 aa  485  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0075  hypothetical protein  86.08 
 
 
237 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0784  hypothetical protein  85.65 
 
 
237 aa  421  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195176  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6128  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  65.52 
 
 
236 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1834  cyclic nucleotide-binding protein  61.18 
 
 
241 aa  298  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3860  cyclic nucleotide-binding protein  59.32 
 
 
237 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1833  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.45 
 
 
237 aa  248  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3376  cyclic nucleotide-binding protein  50.64 
 
 
236 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0789  cyclic nucleotide-binding  48.72 
 
 
240 aa  225  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.424436  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0788  cyclic nucleotide-binding  48.72 
 
 
236 aa  225  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3012  cyclic nucleotide-binding protein  48.46 
 
 
242 aa  208  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791421  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.22 
 
 
239 aa  205  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3374  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.56 
 
 
256 aa  201  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2074  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.85 
 
 
246 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.83722  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6918  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.8 
 
 
255 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2120  cyclic nucleotide-binding  43.67 
 
 
243 aa  182  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0341739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2397  cyclic nucleotide-binding protein  43.67 
 
 
243 aa  182  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5843  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.11 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918646  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7015  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.55 
 
 
241 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0954558  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5762  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.55 
 
 
241 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5837  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.53 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561164  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5879  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.08 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450162  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5885  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.45 
 
 
219 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4765  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.15 
 
 
244 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156733  normal  0.417355 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5594  hypothetical protein  45.41 
 
 
238 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5598  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.66 
 
 
239 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00118165 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6894  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 
241 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.744269 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5764  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 
237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5568  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.34 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192457  normal  0.0307688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5606  cyclic nucleotide-binding protein  39.39 
 
 
241 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.89 
 
 
384 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4306  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
236 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.17 
 
 
245 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0741  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.02 
 
 
241 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.4 
 
 
246 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  35.4 
 
 
246 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4307  cyclic nucleotide-binding protein  36.71 
 
 
243 aa  151  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
250 aa  145  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4966  cyclic nucleotide-binding protein  36.12 
 
 
255 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.916319  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.22 
 
 
243 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
231 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  36.24 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  35.94 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  35.84 
 
 
344 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
238 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3818  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.65 
 
 
265 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.96 
 
 
254 aa  128  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  34.96 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0413  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.89 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  34.96 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  34.96 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  34.96 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  34.96 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5720  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  34.96 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  34.96 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
244 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.93 
 
 
232 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.77 
 
 
239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.22 
 
 
244 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
244 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3464  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.61 
 
 
257 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0401211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  33.19 
 
 
234 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2486  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
266 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215074  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.06 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  33.62 
 
 
439 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0178  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.64 
 
 
237 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.18 
 
 
239 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
239 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  31.47 
 
 
242 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
260 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
251 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
240 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0173  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.17 
 
 
263 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.9 
 
 
247 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
260 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
257 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3742  cyclic nucleotide-binding protein  33.78 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>