99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3481 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3481  cyclic nucleotide-binding domain protein  100 
 
 		 243 aa  500  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0295032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3228  transcriptional regulator  97.83 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000617944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3510  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  98.26 
 
 		 230 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3255  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  98.26 
 
 		 230 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00717521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3461  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  97.39 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1794  cyclic nucleotide-binding domain protein  96.52 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3165  transcriptional regulator  96.52 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3470  cyclic nucleotide-binding domain protein  96.09 
 
 		 230 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3454  cyclic nucleotide-binding domain protein  95.65 
 
 		 230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.636337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3162  cyclic nucleotide-binding protein  94.78 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0336  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.56 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0158598  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2368  catabolite gene activator  32.73 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2964  catabolite gene activator  32.29 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117686  normal  0.0504815 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5089  DNA-binding transcriptional activator YeiL  33.77 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5261  DNA-binding transcriptional activator YeiL  33.77 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00514717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5106  DNA-binding transcriptional activator YeiL  33.77 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.888495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5659  DNA-binding transcriptional activator YeiL  33.77 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5504  DNA-binding transcriptional activator YeiL  33.77 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5589  DNA-binding transcriptional activator YeiL  32.89 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2419  catabolite gene activator  32.11 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5203  DNA-binding transcriptional activator YeiL  32.89 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5538  DNA-binding transcriptional activator YeiL  33.33 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5419  DNA-binding transcriptional activator YeiL  32.89 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2212  cyclic nucleotide-binding protein  31.19 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5533  DNA-binding transcriptional activator YeiL  31.58 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2310  DNA-binding transcriptional activator YeiL  30.7 
 
 		 232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  decreased coverage  0.000186485 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.11 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2460  DNA-binding transcriptional activator YeiL  30.23 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.572747  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  29.82 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288775  normal  0.0803895 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1495  cyclic nucleotide-binding protein  29.82 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02051  hypothetical protein  29.77 
 
 		 219 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02092  DNA-binding transcriptional activator of stationary phase nitrogen survival  29.77 
 
 		 219 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1485  DNA-binding transcriptional activator YeiL  29.77 
 
 		 219 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0399687  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  29.77 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266371  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1300  cyclic nucleotide-binding protein  34.36 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0522  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.47 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192194  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0206  transcriptional regulator  30.62 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000707778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3786  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0919672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1894  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.14 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000758315  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1761  cyclic nucleotide-binding protein  25.79 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.55 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  26.29 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.42 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.47 
 
 		 348 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.42 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.71 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3301  cyclic nucleotide-binding protein  23.96 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00259627 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  22.96 
 
 		 355 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.4 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  24.74 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 226 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.27 
 
 		 352 aa  48.5  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0512  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.28 
 
 		 227 aa  48.9  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.43 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.53 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.58 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.37 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.37 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.52 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  18.14 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.81 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1859  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.82 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.57 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1160  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  24 
 
 		 225 aa  45.8  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06137  hypothetical protein  23.61 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5005  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.12 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62031  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.61 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.91 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0458  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.96 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0605  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.42 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0401  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.96 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.08 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.16 
 
 		 354 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0388  cyclic nucleotide-binding protein  21.6 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.35 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.76 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0780  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.390237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.84 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.6 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0464  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.97 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0498511  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  20.29 
 
 		 225 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 224 aa  42.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.09 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0473  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.97 
 
 		 272 aa  42.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  23.86 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0248  cyclic nucleotide-binding  19.25 
 
 		 224 aa  42  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  17.87 
 
 		 244 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>